大麦白化颖壳突变体的转录组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 栾海业

作者： 栾海业;臧慧;沈会权;张英虎;乔海龙;陶红;申玉香;陈和

作者机构：

关键词： 大麦;白化颖壳突变体;转录组测序;差异基因

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 2332-2339

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究大麦白化颖壳突变体形成机理,以白化颖壳突变体(AL)和野生型植株(WT)为试验材料,对2份材料抽穗期的颖壳进行转录组测序分析,通过Illumina Hi SeqTM2500高通量转录组测序技术分别从WT和AL中获得2.7 Gb和4.1 Gb有效数据,拼接组装后得到64 634条通用基因(unigenes),其中长度大于1 kb的有23 696条。通过对2份材料间差异基因的筛选,共得到672个差异表达基因(DEGs),其中139个上调表达,533个下调表达。GO功能富集分析发现,在分子功能类型中注释的差异基因主要与叶绿体相关;KEGG显著富集分析发现差异基因广泛涉及碳代谢、光合作用等调控途径。对其中6个相关基因进行了RT-qPCR验证,表达趋势与RNA-Seq测序结果一致。表明AL的形成可能是由于叶绿体形成和发育相关基因的表达受到抑制,进一步导致了光合作用的下降,该研究结果对深入探究大麦的白化形成机理具有重要的参考价值。

分类号： S512.3

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