牛病毒性腹泻病毒基因1型全基因组的测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何延华

作者： 何延华;黄新;钟发刚;韩猛立;康立超;王新华;薄新文

作者机构：

关键词： 牛病毒性腹泻病毒;基因组;基因型;相似性

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2012 年 03 期

页码： 253-257

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以我国新疆地区分离的1株牛源牛病毒性腹泻病毒基因1型毒株为研究对象,参照GenBank中的牛病毒性腹泻病毒1型基因组全序列,根据保守序列设计6对重叠引物,通过RT-PCR扩增出该毒株不同的cDNA片段,分别克隆到pMD19-T载体,转化受体菌JM109,挑取阳性克隆进行PCR、酶切鉴定及测序分析,为了解该毒株的遗传变异及基因结构与生物功能的关系,为开发牛病毒性腹泻病毒新型疫苗奠定基础。测序结果表明,该病毒全基因序列核苷酸为12 302nt(GenBank登录号:JN704144),该病毒基因组具有一个11 694nt开放阅读框编码的多聚蛋白,5′-UTR长382nt,3′-UTR长224nt,BVDV1-3156的全基因组序列分析发现该毒株为BVDV1b亚型。Blast比对分析显示,该毒株与VEDEVAC株的相似性最高,为90.9%。该毒株与BVDV1型其他毒株的全基因组序列具有较大的差异。

分类号： S852.659.6

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