大麦HhH-DGS全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王容

作者： 王容;蔡海亚;焦春海;安兵壮;王红盼;李博;杨彩仙;徐延浩

作者机构：

关键词： 大麦;HhH-DGS家族;碱基切除修复;表达模式;辐射应答

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 023 期

页码： 7657-7670

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 螺旋-发夹-螺旋DNA糖基化酶超基因家族（helix-hairpin-helix DNA glycosylases superfamily,HhH-DGS）是DNA碱基切除修复（base excision repair, BER）的关键酶之一，在保持基因组的稳定中发挥着重要作用。本研究分析了大麦（Hordeum vulgare L.） HhH-DGS基因家族的分子特征、系统发育、组织表达模式并探究了该基因家族对辐射的响应规律。在大麦基因组的6条染色体上共鉴定到15个HhH-DGS基因，系统发育将其分为9个亚群。不同亚族间HhH-DGS基因外显子数量变异很大，为2～12个。种间与种内共线性分析表明，该基因家族存在于单子叶与双子叶分化前，在大麦基因组内没有发生大规模扩增。HhH-DGS基因启动子含有大量的光调节因子。大麦萌发期的茎基部及花前期的顶端组织中HhH-DGS基因表达量显著高于其他组织器官；HhH-DGS基因HORVU.MOREX.r3.7HG0667530、HORVU.MOREX.r3.3HG0221280、HORVU.MOREX.r3.3HG0223220和HORVU.MOREX.r3.6HG0561680在大麦不同的器官中稳定表达，并在4种辐射处理后表达都上调。HORVU.MOREX.r3.5HG0469860、HORVU.MOREX.r3.7HG0634400和HORVU.MOREX.r3.1HG0074440表现出特异辐射方式响应模式。本研究在解析大麦HhH-DGS基因家族的特征、进化与功能的基础上，为大麦辐射育种提供了参考。

分类号： S512.3

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