miRNA与其靶mRNA 3′UTR序列的匹配特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙佩智

作者： 孙佩智;李宏;赵小庆;薄素玲;张泽峰;张强;路战远

作者机构：

关键词： miRNA;3′UTR序列;匹配片段;作用区域偏好;G+C含量;配对率

期刊名称： 内蒙古大学学报(自然科学)

ISSN： 1000-1638

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 150-161

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用。基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3′UTR序列为研究对象,分析了miRNA和其匹配片段在3′UTR序列上的位置偏好性。研究发现,miRNA与3′UTR序列相互作用的位置存在区域偏好。低G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端和3′端,高G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端。低G+C含量的匹配片段在3′UTR序列上没有明显的位置偏好,而高G+C含量的匹配片段集中分布在3′UTR序列的5′端。低配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的两端,中等配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的5′端。此外,还分析了miRNA与匹配片段的4种相互作用方式中配对率的差异。研究对于揭示miRNA对基因表达调控的多样性提供了新的思路。

分类号： Q811.4

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