番茄SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5基因的克隆及低温胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王鹏

作者： 王鹏;田哲娟;赵雪芳;康忱;吴志明;李亚栋;黄冀楠

作者机构：

关键词： 番茄;钙调蛋白;低温;基因克隆;qRT-PCR;表达分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 75-84

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 钙调蛋白是植物体内一种重要的Ca2+受体蛋白，在钙信号途径及抗逆反应中发挥着重要作用。为研究番茄CaM蛋白在低温胁迫下的作用机制，以番茄品种Heinz1706、LA3969、冀粉2号、冀粉3号和农博粉霸15为材料，克隆得到了番茄钙调蛋白基因SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5,并进行序列分析和启动子区顺式作用元件分析；利用qRT-PCR技术分析SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5在不同番茄品种中15,5℃低温胁迫下的表达模式，并结合RNA-seq数据分析组织特异性表达情况。结果显示，SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5的CDS序列均为450 bp,三者相似度为93.63%;所编码的氨基酸序列完全相同，属酸性稳定亲水蛋白，具有典型的CaM蛋白保守结构域。启动子顺式作用元件分析表明，3个基因的启动子区除含有必需的核心元件外，还含有多种生物及非生物胁迫响应元件，并呈现互补模式分布。不同程度低温胁迫表达模式分析表明，15℃胁迫下，SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5基因在5种番茄材料中的表达模式均呈现出先降低后升高的趋势，其中SlCaM5基因的表达量升高更为显著；5℃胁迫下，SlCaM3、SlCaM4基因的表达水平变化不明显，而SlCaM5基因在处理后期表达量显著升高；表明SlCaM5在低温下维持着CaM蛋白的翻译水平。SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5基因在Heinz1706不同组织中的特异性表达情况显示，SlCaM3和SlCaM4在分生组织中具有较高的表达，而SlCaM5基因在不同组织中表达水平差异不明显。

分类号： S641.2

  • 相关文献

[1]巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,阳江华,秦云霞,唐朝荣. 2016

[2]茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析. 陈林波,李叶云,王琴,高永亮,江昌俊. 2010

[3]茶树抗逆相关基因ERF的克隆与表达特性分析. 陈林波,房超,王郁,李叶云,江昌俊,梁名志. 2011

[4]核桃FRUITFULL(JrFUL)基因的克隆及表达分析. 王企,陈利娜,夏小丛,敬丹,李好先,骆翔,曹尚银. 2019

[5]番茄抗黄化曲叶病毒病相关基因ClNLR的功能分析. 李楠,杨玛丽,陈天子,张保龙,赵统敏,杨郁文,刘廷利,余文贵. 2014

[6]番茄NAC转录因子SlNAC80的克隆及表达分析. 刘辉,王涛涛,张俊红,欧阳波,李汉霞. 2015

[7]番茄低温响应转录因子SlNAC41克隆及表达分析. 刘辉,王涛涛,张俊红,欧阳波,李汉霞. 2014

[8]三疣梭子蟹钙调蛋白基因的克隆及在蜕皮中的功能分析. 张龙涛,吕建建,高保全,刘萍. 2015

[9]花生(Arachis hypogaea L.) CaM基因克隆与序列分析. 孟玉环,单世华,李春娟,庄伟建,蔡宁波. 2007

[10]木榄CaM基因的克隆及序列分析. 庞俊峰,于卓,张占路,房永雨,唐益雄,吴燕民. 2010

[11]基于RNA-Seq挖掘桃低温应答相关基因的研究. 李小兰1,2,郝兰兰1,2,张帆1,王鸿1,2. 2022

[12]茶树CsPLt基因的荧光定量PCR分析. 陈林波,夏丽飞,梁名志,江昌俊. 2011

[13]辣椒细胞质雄性不育相关基因的克隆与表达分析. 刘科伟,王述彬,刁卫平,戈伟. 2017

[14]木薯查尔酮合酶MeCHS基因家族特征与表达分析. 安飞飞,齐剑雄,陈松笔,罗秀芹,蔡杰,薛晶晶. 2023

[15]辣椒AP2/ERF家族转录因子CaERF109的克隆和表达分析. 高升华,李宁,王飞,尹延旭,余楚英,焦春海,姚明华. 2019

[16]丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析. 龚婷,刘灵娣,温春秀,武玉翠,王升,万修福,孙亚倩,姜涛. 2024

[17]柔嫩艾美耳球虫真核起始因子5和5A基因的克隆表达及转录动态分析. 苟灵俏,龚振兴,于三科,殷昊,马雪婷,蔡建平,林青. 2014

[18]半矮生型桃F-box基因的克隆和表达特征分析. 王玉兰,鲁振华,王志强,牛良,崔国朝. 2013

[19]斑节对虾GTF2H4基因的分子克隆及表达分析. 王艳,傅明骏,赵超,周发林,杨其彬,邱丽华. 2016

[20]柔嫩艾美耳球虫多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2的基因表达及转录动态分析. 刘晓丽,龚振兴,马雪婷,曲自刚,韩政岚,刘保红,袁如意,杨孝朴,蔡建平. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序