上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒流行株HN基因遗传进化和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘健

作者： 刘健;周锦萍;徐卫兵;白艺兰;杨显超;桂亚萍;夏琦琦;徐锋;沈莉萍;刘佩红;王建

作者机构：

关键词： 鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1);HN基因;遗传进化分析;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 011 期

页码： 5371-5380

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]了解上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒(PPMV-1)流行株HN基因遗传进化情况,探讨PPMV-1免疫失败的原因,为研发PPMV-1新型疫苗和抗病毒药物提供技术支持.[方法]采集临床送检疑似PPMV-1感染鸽样品(脑、气管、肺脏、肝脏、胰腺和脾脏),应用RT-PCR方法进行PPMV-1鉴定,阳性样品进行HN基因测序和遗传进化分析,并通过生物信息学在线软件对HN蛋白结构功能进行分析.[结果]送检鸽鉴定为PPMV-1阳性,其HN基因全长为2 002 bp,编码区全长1 716 bp,编码571个氨基酸,与PPMV-1国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013核苷酸相似性最高,为99.8%,与新城疫(NDV)疫苗株La Sota和Mukteswar核苷酸相似性分别只有83.6%和85.5%.遗传进化分析显示,流行株属于NDV Class Ⅱ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型,与NDV国内分离株Pi/SH/CH/0617/2013和pigeon/Ningxia/2068/2016同处一个分支,与La Sota和Mukteswar处于不同分支.HN蛋白为亲水性蛋白,分子质量约为62.71 ku,理论等电点(pI)为7.88,半衰期为30 h,不稳定系数为30.44,脂肪系数为85.48;该蛋白主要分布在线粒体和细胞质中,无信号肽,含有1个跨膜结构、5个潜在的N-糖基化位点、105个O-糖基化位点、13个半胱氨酸残基和75个磷酸化位点.HN蛋白二级结构、三级结构预测以无规则卷曲占比最高,其次为β-折叠和α-螺旋;B细胞抗原表位预测显示,HN蛋白含有10个抗原表位(氨基酸长度≥7).[结论]上海地区PPMV-1流行株属于NDV强毒株的Class Ⅱ群Ⅵ.2.1.1.2.2亚型,其HN蛋白具有较好的抗原表位,可作为PPMV-1疫苗研制和抗病毒治疗的靶蛋白.本研究结果为PPMV-1HN基因遗传进化、蛋白表达、新型疫苗研发和抗病毒药物的筛选等提供理论依据.

分类号： S852.65

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