PRRSV HuN-2011株ORF5和ORF7基因的序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 贺冬梅
作者: 贺冬梅;谭树义;陈朝喜;徐静伟;田语诗;魏玉情;曹宗喜
作者机构:
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);HuN-2011株;ORF5;ORF7;序列分析;基因缺失
期刊名称: 黑龙江畜牧兽医
ISSN: 1004-7034
年卷期: 2017 年 07 期
页码: 188-191
收录情况: 北大核心
摘要: 为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传进化特点,试验采用RT-PCR技术,扩增PRRSV Hu N-2011株的ORF5和ORF7基因,并对其进行序列测定,利用生物信息学软件进行遗传进化分析。结果表明:PRRSV Hu N-2011株属于美洲型变异株,其ORF5和ORF7与EF112447 HEB1、JX235370 11GZ-GD、KF751237 BJ1102O、KJ546412 He Nan-A9、GQ359108 SD-CXA-2008等PRRSV变异株等位基因核苷酸的相似性分别为95.0%~96.4%、97.0%~99.5%,推导氨基酸的相似性分别为83.6%~91.5%、98.4%~100%;与经典毒株AY262352 HB-2(sh)2002核苷酸的相似性为90.4%、93.5%,推导氨基酸的相似性为94.5%、91.9%;与两株美洲型经典毒株VR-2332核苷酸的相似性为87.4%和86.7%、94.4%和93.8%,推导氨基酸的相似性为88.6%和94.5%、96.0%和95.2%;进化树分析表明,Hu N-2011株与JX235370 11GZ-GD的遗传距离最近,与经典毒株AY262352 HB-2(sh)2002和EF536003 VR2332属于同一亚群,但与欧洲型GU737264 07V063和GU067771 Amervac PRRS属于不同亚群。说明Hu N-2011株为美洲型变异株。
分类号: S852.65
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