PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 范悦轩

作者： 范悦轩;马佳镁;黄春媛;郑佳馨;陈素贞;张艳;刘光亮;曹宗喜

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征;遗传进化;ORF5;ORF7

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1292-1300

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品，分离出PRRSV HNHK3-2021毒株，并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列，采用Lasergene 7.1进行序列比对分析，用MEGA-X进行遗传演化分析。【结果】分离出的PRRSV HNHK3-2021株为美洲型毒株，PRRSV HNHK3-2021株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5和ORF7的核苷酸相似性较高，分别为99.2%～99.3%和99.5%～100%,推导氨基酸相似性为99%～99.5%和100%;PRRSV HNHK3-2021株和EU864232 SHB、AY262352＿HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为87.1%～96.4%和91.4%～97.3%,推导氨基酸的相似性为86.6%～93%和91.9%～97.6%;PRRSV HNHK3-2021株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为85.4%～87.1%和89%～91.4%。氨基酸的相似性为86.1%～87.1%和89.5%～91.9%。【结论】RRSV HNHK3-2021毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。

分类号： S852.651

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