鸭圆环病毒ORF-C1基因的扩增及遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吕振环
作者: 吕振环;赵莎;卢凤英;杨婧;韩凯凯;黄欣梅;赵冬敏;章丽娇;吴凤瑶;刘宇卓;李银;刘青涛;张小飞
作者机构:
关键词: 鸭圆环病毒;ORF-C1基因;遗传进化分析
期刊名称: 畜牧与兽医
ISSN: 0529-5130
年卷期: 2023 年 55 卷 005 期
页码: 63-69
收录情况: 北大核心
摘要: 鸭圆环病毒(DuCV)感染能够引起鸭的免疫抑制,引起多种病原的继发性感染,在我国鸭群中广泛流行.为了解DuCV的遗传变异情况,对采自山东、江苏和贵州3个省份的19个鸭场的样品进行了 PCR测定,并对DuCV的ORF-C1基因进行测序和遗传进化分析.PCR测定结果显示,19个鸭场中有9个鸭场的样品为DuCV阳性,总体阳性率为47.4%;ORF-C1基因序列测定结果显示,9株DuCV之间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为93.4%~100%和82.2%~100%,与NCBI中已公布的DuCV毒株的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为77.8%~99.5%和71.5%~-99.6%;遗传进化分析显示,9株DuCV全部属于DuCV-1b亚型,其中有7株在同一分支上,与D11-JW-001等韩国毒株遗传距离较近,另外2株则与山东、广西的毒株遗传距离较近;此外,与已公布的毒株相比,9株DuCV都在158位发生了氨基酸突变,由E/D变为L/P.上述结果表明,DuCV-1仍然为我国鸭群中的优势流行基因型,但病毒的基因也在不断地发生变异,应该对其进行持续监测.
分类号: S852.65
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