棉花逆境应答GhWRKY2基因的结构与功能预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 司爱君

作者： 司爱君;余渝;陈红;田琴

作者机构：

关键词： 棉花;WRKY转录因子;基因克隆;序列分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2017 年 25 卷 02 期

页码： 222-230

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY是一类与植物抗逆相关的转录因子,通过激活下游一系列抗逆应答基因的表达而提高植株的综合抗性。本研究通过基因芯片从陆地棉(Gossypium hirsutum)中筛选出一个逆境诱导WRKY转录因子基因GhWRKY2,属于Ⅱ亚组。采用RT-PCR技术获得GhWRKY2基因cDNA全长,并对其进行序列分析及结构功能预测。根据GhWRKY2蛋白序列进行同源性搜索,得到与GhWRKY2蛋白序列相似度较高的其他物种的蛋白序列,使用MEGA7软件对GhWRKY2蛋白序列及其同源序列进行多序列比对分析并构建同源物种间系统进化树。利用在线工具Prot Param和Motif scan对GhWRKY2进行氨基酸理化性质分析;利用SMART在线工具进行蛋白序列分析;利用SWISS-MODEL在线工具分别对GhWRKY2基因结构和三级结构进行分析。结果表明,GhWRKY2核苷酸序列ORF为942 bp,编码313个氨基酸,预测蛋白分子量为34.22 k D,等电点为8.76。在拟南芥原生质体中,GhWRKY2定位于细胞核内,且具有转录激活活性。逆境应答GhWRKY2基因的克隆,为进一步从分子水平上验证其抗逆生物学功能以及揭示棉花非生物胁迫抗逆机制奠定基础,并为棉花抗逆育种提供新的候选基因。

分类号： Q943.2`S562

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