橡胶树ADC1的克隆、表达及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 侯岚菲
作者: 侯岚菲;杨洪;邓治;代龙军;门中华;李德军
作者机构:
关键词: 橡胶树;精氨酸脱羧酶;基因克隆;生物信息学;实时荧光定量PCR
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2018 年 011 期
页码: 111-119
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC)是高等植物多胺合成的重要酶.为对橡胶树ADC基因表达模式及生物信息学进行分析,采用PCR和测序技术从橡胶树中克隆了一个ADC基因(HbADC1),获得的HbADC1序列长2 594 bp,开放阅读框为2 175 bp,编码724个氨基酸.生物信息学预测HbADC1理论分子量和等电点分别为77.7 kD和5.14.进化分析表明,HbADC1与大戟科植物木薯、麻风树的ADC聚为一支.qRT-PCR分析表明,HbADC1表达无组织特异性,在雌花中表达量最高,茎尖、雄花、叶片、树皮和胶乳次之.HbADC1在不同发育时期叶片中的表达存在变化,稳定期表达量最低,淡绿期最高,说明HbADC1可能参与橡胶树叶片发育过程.此外,HbADC1表达受伤害、低温、干旱、高盐、过氧化氢及乙烯调控,表明HbADC1可能参与橡胶树逆境胁迫和乙烯应答过程.
分类号: S794.1
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