香菇"沪香F2"自交群体产量等性状的GWAS分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨沁閻

作者： 杨沁閻;李巧珍;向泉桔;尚晓冬;章炉军;辜运富

作者机构：

关键词： 香菇子实体;农艺性状;GWAS;SNP;候选基因

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2024 年 42 卷 006 期

页码： 1280-1291

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为有效利用分子辅助育种技术提高香菇产量，挖掘定位SNP位点与候选基因。【方法】以“沪香F2”自交后代的100株菌株为研究对象，采用全基因组重测序获得供试菌株的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）数据，结合在栽培过程中统计的子实体产量相关性状表型数据，开展单性状全基因组关联分析（genome wide association study, GWAS）。【结果】定位到产量性状相关的主效区间位于1号染色体2 585 129～4 051 693区段，共有1 306个显著SNP位点；定位到与菇蕾性状中一潮平均蕾数关联的29个SNP显著位点，与一潮现蕾天数性状关联的199个SNP显著位点；定位到与菌棒品质性状中的软硬度性状关联的109个SNP显著位点，与转色性状关联的29个SNP显著位点；筛选到与产量性状相关的12个候选基因，与菇蕾性状相关的10个候选基因，与菌棒品质性状相关的2个候选基因。【结论】首次利用GWAS分析香菇单亲本群体，为改良香菇产量提供有效的候选分子标记，有利后续分子辅助育种开展，同时为后续功能基因精细定位奠定了基础。

分类号： S646.12

  • 相关文献

[1]低磷胁迫下大豆苗期根系性状全基因组关联分析. 孙畅,刘美玲,刘子君,杨光,梁腾月,周宣汝,赵悦如,张洛桐,谷勇哲,敖雪. 2024

[2]利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因. 郑洪亮,孙世臣,丁国华,王彤彤,赵宏伟,王敬国,刘化龙,韩笑,邹德堂,来永才. 2021

[3]冬小麦籽粒主要品质性状的全基因组关联分析. 董一帆,任毅,程宇坤,王睿,张志辉,时晓磊,耿洪伟. 2023

[4]功能基因筛选方法的研究进展. 姚雅馨,喇永富,汤继顺,贺小云,张壮彪,储明星. 2020

[5]基于GWAS和WGCNA分析挖掘玉米花期相关候选基因. 钱甫,张占琴,陈树宾,丁永福,桑志勤,李卫华. 2023

[6]家畜多胎性状的基因组学研究进展. 田菁,赵濛,李慧,Hojjat Asadollahpour Nanaie,王潇,陈陆,王婷月,金露达,何云梅,赵鸿雁,田如刚. 2025

[7]鸡重要性状全基因组关联分析研究现状及展望. 潘爱銮,皮劲松,申杰,吴艳,蒲跃进,梁振华,张昊,孙静,程妮,杜金平. 2017

[8]斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析. 龚明,李燕,鲍大鹏,尚俊军,杨瑞恒,周陈力,万佳宁,吴莹莹. 2021

[9]大豆低聚糖优异种质鉴定及GWAS分析. 李岩哲,熊雅文,许亚男,唐威,张红梅,张威,刘晓庆,王琼,许文静,张群,陈华涛. 2023

[10]小麦根部耐盐性状全基因组关联分析. 时晓磊,严勇亮,石书兵,王继庆,谢磊,张金波,耿洪伟. 2021

[11]特克赛尔羊*阿勒泰羊F2绵羊肉质嫩度全基因组关联分析. 赵义龙,黄金凤,贺三刚,刘明军. 2024

[12]辣椒果色全基因组关联分析. 张小微,陈小翠,陈仕泽,覃成,杨红,唐相群,邱化荣,罗希榕. 2023

[13]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 2015

[14]玉米叶片硝酸盐积累性状的全基因组关联分析. 邬奇,孙扬名,桑俊伟,周玲,赵涵. 2024

[15]栽培大豆×半野生大豆高密度遗传图谱构建及株高QTL定位. 于春淼,张勇,王好让,杨兴勇,董全中,薛红,张明明,李微微,王磊,胡凯凤,谷勇哲,邱丽娟. 2022

[16]豇豆SNP高密度遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位. 李建领,公丹,王素华,陈红霖,程须珍,熊涛,王丽侠. 2022

[17]国内外谷子资源农艺、品质性状差异分析以及遗传多样性研究. 薛亚鹏,辛旭霞,王若楠,于筱菡,刘少雄,王瑞云,刘敏轩. 2024

[18]基于通路分析剖析水稻农艺性状配合力和杂种优势. 向丽媛,徐凯,苏静,吴超,袁雄,郑兴飞,刁英,胡中立,李兰芝. 2019

[19]高粱抗丝黑穗病分子遗传机制研究进展. 白春明,陆晓春. 2017

[20]蛋鸡资源群体的盲肠长度全基因组关联分析. 王星果,曲亮,卢建,窦套存,马猛,胡玉萍,沈曼曼,郭军,李尚民,王克华. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序