长穗偃麦草EeDREB2基因的克隆与生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙珊珊
作者: 孙珊珊;杨涛;柳珊;陈京瑞;赵昌平;唐益苗;高世庆
作者机构:
关键词: 长穗偃麦草;EeDREB2;基因克隆;系统进化分析;亚细胞定位
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2013 年 15 期
页码: 149-156
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了进一步研究EeDREB2基因的结构和功能特点并为转基因小麦挖掘有效的候选基因,应用同源克隆的方法从长穗偃麦草中克隆出EeDREB2基因,通过生物信息学的手段对EeDREB2基因进行初步的分子特征分析。结果显示,该基因全长1035bp,编码344个氨基酸,理论上的等电点为4.85,分子量为37485.49Da,属于亲水性蛋白,有20个磷酸化位点。亚细胞定位预测显示EeDREB2基因定位在细胞核中,表达谱分析预测表明EeDREB2在根、茎、叶、花、种子中都表达,其中叶中表达量最高。同源性分析发现,EeDREB2与TaDREB4B同源性最高。EeDREB2基因的克隆为转基因小麦的抗逆性研究提供了有效资源。
分类号: S512.1
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