利用WGCNA对受白粉菌侵染后的拟南芥转录组差异基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尚鸿运

作者： 尚鸿运;高志勇

作者机构：

关键词： 加权基因共表达网络;拟南芥;白粉菌;转录组

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 020 期

页码： 6734-6742

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块.筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因.功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联.其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路.

分类号： S432.44

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