基于16S rRNA测序技术分析山羊皮肤脓包菌群结构特征
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨金柯
作者: 杨金柯;郝雨;崔卉梅;赵登率;袁兴国;陈学辉;杨博;张婷;郑海学;刘湘涛;张克山
作者机构:
关键词: 山羊;皮肤脓包;16S rRNA;微生物多样性;菌群结构
期刊名称: 中国兽医科学
ISSN:
年卷期: 2021 年 009 期
页码: 1073-1081
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探讨山羊体表脓包中的微生物多样性,运用高通量测序技术对脓包积液中的16S rRNA和ITS基因测序。根据获得的有效序列和操作分类单元(OTU)数目,进行α多样性分析和菌群结构组成分析。结果表明,脓包中细菌和真菌OTU数目分别为53和410;细菌群落中优势菌属分别为葡萄球菌属(Staphylococcus,98.04%)、梭杆菌属(Fusobacterium,80.62%)和拟杆菌属(Bacteroides,19.32%),真菌群落中没有明显优势菌群。本研究通过16S rRNA高通量测序技术,分析了可能引起山羊皮肤脓包的病原微生物,为皮肤脓包病的防控和临床指导用药提供了参考。
分类号: S852.61
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