基于16S rRNA测序技术分析山羊皮肤脓包菌群结构特征

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨金柯

作者: 杨金柯;郝雨;崔卉梅;赵登率;袁兴国;陈学辉;杨博;张婷;郑海学;刘湘涛;张克山

作者机构:

关键词: 山羊;皮肤脓包;16S rRNA;微生物多样性;菌群结构

期刊名称: 中国兽医科学

ISSN:

年卷期: 2021 年 009 期

页码: 1073-1081

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探讨山羊体表脓包中的微生物多样性,运用高通量测序技术对脓包积液中的16S rRNA和ITS基因测序。根据获得的有效序列和操作分类单元(OTU)数目,进行α多样性分析和菌群结构组成分析。结果表明,脓包中细菌和真菌OTU数目分别为53和410;细菌群落中优势菌属分别为葡萄球菌属(Staphylococcus,98.04%)、梭杆菌属(Fusobacterium,80.62%)和拟杆菌属(Bacteroides,19.32%),真菌群落中没有明显优势菌群。本研究通过16S rRNA高通量测序技术,分析了可能引起山羊皮肤脓包的病原微生物,为皮肤脓包病的防控和临床指导用药提供了参考。

分类号: S852.61

  • 相关文献

[1]基于高通量测序分析牛呼吸系统疾病鼻咽微生物多样性和功能预测研究. 张静,张涛,卢昱希,任荣清,黄波,周思旋,王婧,赵春萍,史开志,张雄. 2021

[2]绵羊体表脓包病原的分离·鉴定及药敏试验. 张晓,刘志杰,杨吉飞,陈泽,关贵全,刘爱红,任巧云,罗建勋,殷宏,李有全. 2014

[3]刺参苗期附着基更换频率对刺参生长及其养殖系统菌群结构的影响. 王印庚,张文泽,廖梅杰,李彬,荣小军,张正,李华,范瑞用,宁鲁光. 2016

[4]基于高通量测序的丁酸梭菌对肉鸡盲肠菌群结构的影响. 肖英平,杨彩梅,代兵,李开锋,陈镜刚,杨华. 2017

[5]采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响. 肖英平,何祥祥,戴宝玲,桂国弘,唐标,杨华. 2017

[6]室内培育不同产地卤虫的成虫肠道菌群结构分析. 茹文红,段亚飞,郑晓婷,董宏标,刘青松,张家松. 2018

[7]家禽屠宰场微生物菌群结构及大肠杆菌耐药性评估. 王佩佩,戴贤君,杨华,肖英平. 2019

[8]硝化型生物絮团的驯化培养. 田道贺,桂福坤,李华,周子明,刘青松,董宏标,段亚飞,张家松. 2019

[9]家禽屠宰场环境和屠宰器械表面微生物菌群结构和耐药基因分析. 王佩佩,杨华,戴贤君,桂国弘,肖英平. 2018

[10]牛至精油和莫能菌素对荷斯坦犊牛瘤胃发酵参数和菌群结构的影响. 柏妍,王彩莲,郎侠,刘婷,宫旭胤,石晓雷,张瑞,吴建平. 2019

[11]冷鲜鸡冷藏保存过程中菌群结构变化分析. 桂国弘,杨华,朱江群,朱建芬,肖英平,徐娥. 2019

[12]蜂花粉微生物污染及菌群结构分析. 唐标,罗怡,李锐,周秀楠,张玲,钱鸣蓉,戴贤君,夏效东,杨华. 2020

[13]家禽定点屠宰场不同屠宰区域空气的微生物结构. 戴宝玲,肖英平,孙凤来,王佩佩,桂国弘,戴贤君,杨华. 2018

[14]饲养密度对番鸭屠宰性能和肠道菌群结构的影响. 李娜,肖英平,吕文涛,朱江群,卢立志,夏文锐,杨华. 2020

[15]缓冲蛋白胨水前增菌对冷鲜鸡表面微生物变化的影响. 桂国弘,徐娥,杨华,陈小敏,温雪婷,肖英平. 2018

[16]发酵剂对发酵牛肉干菌群结构及生物胺组成的影响. 徐龙,张邦建,韩永霞,崔丽娟,梁蕊芳,王德宝. 2020

[17]丁酸梭菌对断奶仔猪盲肠菌群结构和产丁酸代谢的影响. 张红芳,施伟领,马灵燕,吕文涛,杨彩梅,杨华,吴酬飞,肖英平. 2023

[18]凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)循环水养殖系统中养殖效果及菌群结构和功能研究. 唐亚鹏,董世瑞,田吉腾,周茜,王印庚,张天时. 2022

[19]对两种不同投料方式的大黄鱼肠道菌群结构分析. 柯翎,李素一,张丽娟,陈华,林晨韬,龚晖,陈叙. 2019

[20]无抗日粮中添加后生元对断奶仔猪生长性能及肠道菌群结构的影响. 吴飞,刘虎,马树良,胥学新,吴连福,潘宝海. 2021

作者其他论文 更多>>