文献类型: 中文期刊
第一作者: 贾慧茹
作者: 吴艳艳;王强;代平礼;周婷
作者机构:
关键词: 意大利蜜蜂;慢性麻痹病病毒;RT-PCR;系统发育树
期刊名称: 中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2016 年 49 卷 10 期
页码: 2017-2026
收录情况: 北大核心
摘要: 【目的】前期笔者课题组对北京地区蜂群进行了常见病毒感染情况的调查,发现蜜蜂慢性麻痹病毒(Chronic bee paralysis virus,CBPV)在病蜂群中的检出率显著高于在健康蜂群中的检出率,据此推测可借助病蜂群对CBPV进行研究。鉴于目前国内CBPV流行病学数据的匮乏,论文旨在了解中国主要养蜂区病蜂群中CBPV的分布及遗传变异情况,以期为该病的防控提供依据。【方法】2014—2015年间从四川、安徽、浙江、河南、山东、山西、黑龙江、北京8个主要养蜂省(市)共采集到136份病蜂样品,采用RT-PCR法检测CBPV的感染情况。每份样品随机选取10只蜜蜂,取其头部,利用Trizol法提取样品的总RNA;通过凝胶电泳及Nanodrop ND-2000对总RNA的质量进行定性与定量检测。以样品总RNA为模板合成cDNA第一条链,而后以cDNA为模板扩增CBPV的特异性片段。所有扩增片段均进行琼脂糖凝胶电泳,对部分阳性样品进行测序与序列分析;通过扩增片段与阳性片段的比对确定每份样品中CBPV的检出情况。为研究CBPV中国分离株的系统发育特性,以样品cDNA为模板,扩增全部阳性样品的Rd RP基因(RNA-dependent RNA polymerase)特异性片段,而后进行测序与序列分析。将序列提交至GenBank获取基因登录号。对获得的分离株的Rd RP基因与GenBank上发表的相应序列进行比较分析,利用CLUSTAL W软件对全部参考序列及本研究获得的分离株的对应序列进行同源性比对,应用软件MEGA 6.0中邻接法(neighbor-joining)对所有序列绘制系统进化树。【结果】蜜蜂头部总RNA质量检测结果显示,所有样品的总RNA相对完整,且浓度处于(980.5±37.1)ng·μL~(-1)范围内,A260/A280在1.92—2.24。CBPV感染率检测结果显示,136份病蜂样本中共检出120份CBPV阳性样品,阳性率高达88.2%。全部阳性样品的电泳结果可见与预期大小一致的特异性片段,其序列与靶序列同源性达到99%以上。Rd Rp基因特异性片段的序列分析表明,本研究共获得8个CBPV中国分离株,其序列与多种其他地区的CBPV的相应序列同源性达到97%以上。中国分离株GenBank登录号分别为KT374042—KT374049。对其系统进化树分析后可知,世界流行的CBPV分离株可分为5个进化分支:两个欧洲分支(European clade 1、European clade 2),两个中日混合分支(Chinese-Japanese clade 1、Chinese-Japanese clade 2)和一个美国分支(US clade)。获得的8个中国分离株均存在于同一进化分支上,且与之前得到的6个江苏分离株以及4个日本分离株共同形成两个混合分支。【结论】进一步证实了中国病蜂群中普遍存在CBPV感染;系统进化关系表明,目前国内CBPV分离株之间的遗传关系无明显地域性特征,与日本分离株亲缘关系较近。有关CBPV的监测工作亟需加强,且其预警作用需引起重视。
分类号: S895
- 相关文献
[1]贵州中药材钩藤属植物的分子鉴定. 陶刚,刘涛,朱英,刘作易. 2008
[2]中国甘薯小象甲的rDNA ITS-1遗传变异及入侵来源研究. 于海滨,沈江卫,马娟,马辉杰,陈书龙. 2011
[3]亚洲玉米螟化性遗传规律研究. 黄艳玲,袁海滨,李启云,高月波,张正坤,王振营. 2015
[4]我国一株新型黄头病毒的分子流行病学. 朱罗罗,张庆利,万晓媛,邱亮,马芳,黄倢. 2016
[5]利用rDNA ITS序列对新疆桃和普通桃亲缘关系的分析. 姜生秀,兰海燕,廖明康. 2013
[6]产β-D-葡萄糖苷酶乳酸菌的筛选、鉴定及系统发育分析. 周俊,夏秀东,李亚辉,王英,董明盛,周剑忠. 2018
[7]野生鸡瑽菌鉴定及最适菌株、培养基的筛选. 周会明,张焱珍,柴红梅,孔令舰,刘芳艳,陆艺娇,雷启丽,黄雯. 2018
[8]八株蜡蚧轮枝菌的生物学特性及其对烟蚜致病性的影响. 蔡春霞,李茂业,陈德鑫,潘敬,刘明科,齐禹哲,肖丽娜,任春燕,刁朝强,徐传涛,沈祥祥,邓双跃. 2018
[9]徐淮地区7个甘薯茎线虫群体的形态学及分子生物学鉴定. 陈晶伟,马居奎,张成玲,杨冬静,唐伟,谢逸萍,孙厚俊. 2021
[10]猪流行性腹泻病毒HB201602株的分离鉴定及S1基因序列分析. 刘威,袁芳艳,周丹娜,刘泽文,杨克礼,段正赢,郭锐,高婷,梁婉,田永祥. 2019
[11]湖南辣椒疫霉病菌ITS的扩增和序列分析. 张卓,张德咏,谭新球,刘二明,刘勇. 2014
[12]DNA条形码技术在小花蝽属昆虫分类鉴定中的应用. 胡泽章,孙猛,吕兵,段敏,翟一凡,陈浩,郑礼,于毅. 2017
[13]高产柚苷酶菌株的筛选及鉴定. 单杨,夏金兰. 2015
[14]DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用. 万方浩,张爱兵,闵亮,张桂芬. 2012
[15]栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析. 俞立璇,刘美艳,曹清河,余益成,谢逸萍,罗永海,韩永华,李宗芸. 2014
[16]山东烟区首次发现番茄斑萎病毒侵染. 张万红,冯佳,ALI Kamran,罗健达,杨举田,王术科,宗浩,申莉莉,李莹,王凤龙,张石飞,杨金广,金轲. 2020
[17]基于线粒体COI基因的3种草蛉的系统发育关系分析. 胡红岩,张职显,卢珍华,任相亮,马小艳,马亚杰,宋贤鹏,马艳. 2021
[18]鸡艾美耳球虫18S rDNA序列与系统进化分析. 蔡兰,韩红玉,黄兵,董辉,赵其平,姜连连. 2011
[19]O型口蹄疫病毒VP1基因区序列系统发育树分型. 相磊,章振华,胡国良,陈小玲,梁之昶,徐福洲,石岗. 2007
[20]甘蔗组培苗2种污染细菌的分离与鉴定. 刘红坚,李松,何为中,刘俊仙,刘丽敏,卢曼曼,游建华,黄诚华,林善海. 2021
作者其他论文 更多>>
-
miRNA调控鸡脂质代谢研究进展
作者:李永峰;王星果;邵丹;王强;曲亮;童海兵
关键词:脂质代谢;miRNA;遗传调控;鸡
-
西番莲HSF基因家族的全基因组鉴定及成花期对高温胁迫的响应
作者:吴艳艳;刘洁云;周俊妞;田青兰;黄伟华;朱陈利;牟海飞
关键词:西番莲;高温胁迫;热激转录因子;同源基因;成花;转录组测序;候选基因
-
蚕豆种质资源抗赤斑病鉴定与评价
作者:龙珏臣;杜成章;王萍;武云霞;张志良;邓豪;王强;李沅根;唐明双;张继君
关键词:蚕豆;赤斑病;田间鉴定;人工接种;抗性评价
-
农田中无脊椎动物对抗生素和抗生素抗性基因环境行为的影响研究进展
作者:李洁玲;史非凡;郭瑞;陈照明;成琪璐;王强;叶静;马军伟;林辉
关键词:抗生素;无脊椎动物;土壤动物;农田生态系统;抗生素抗性基因
-
基于PLC的枣枝粉碎机控制系统设计与试验
作者:王强;何磊;周艳;宋龙;王治民;卢雨
关键词:枣枝;粉碎机;控制系统;PLC;调速
-
育成期能量限饲及转换为自由采食调控开产时蛋鸡生殖器官发育的关键基因和信号通路研究
作者:卢建;马猛;郭军;王星果;窦套存;胡玉萍;王强;李永峰;邵丹;童海兵;郭杰;曲亮
关键词:蛋鸡;育成期能量限饲;生殖器官;RNA-seq;卵巢
-
液相色谱-串联质谱法手性拆分和测定水产品中奥沙西泮和替马西泮对映体
作者:王旭峰;王强;侯超苹;杨金兰;黎智广;张英侠;李惠青;黄珂
关键词:液相色谱-串联质谱法;对映体;手性拆分;分散固相萃取;水产品