基于16S.rRNA高通量测序技术分析生鲜水牛乳在加工前的细菌多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢芳

作者： 谢芳;谢华德;李孟伟;唐振华;杨承剑

作者机构：

关键词： 16S rRNA高通量测序;生鲜水牛乳;冷藏;细菌多样性

期刊名称： 中国奶牛

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 52-58

摘要： 本研究利用16S rRNA高通量测序分析生鲜水牛乳加工前的细菌多样性。分别提取刚挤出30min内,及冷藏5h、12h及24h的水牛乳样本细菌总DNA,PCR扩增其16S rDNA,利用纯化后的扩增片段构建其菌群的16S rDNA文库,采用Miseq PE300进行高通量测序及BLAST比对。结果显示,在属水平,刚挤出30min～冷藏5h组中的优势菌属为金黄杆菌属（39.28%）、巨型球菌属（16.47%）、乳球菌属（9.61%）,而在冷藏12～24h组中则以不动杆菌属（34.95%）、芽孢杆菌属（11.2%）、库特氏菌属（9.01%）为优势菌属。葡萄球菌属在刚挤出组中未检出,但随着冷藏时间的延长,其丰度呈上升趋势。可以得出,生鲜水牛乳从刚挤出至冷藏24h内,其微生物群落结构和组成呈动态变化,且此次测序中条件致病菌检出率较高,冷藏12h后样本组中细菌多样性显著高于其他组,由此可知生鲜水牛乳从挤出至加工前,低温贮藏时间越短越好,最好控制在5h内。

分类号： TS252.7

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