玉米钙依赖蛋白激酶全基因组鉴定及抗旱表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈果
作者: 陈果;郝晓燕;高升旗;胡文冉;赵准;黄全生
作者机构:
关键词: 钙依赖蛋白激酶;全基因组鉴定;干旱胁迫;表达分析;玉米
期刊名称: 新疆农业科学
ISSN: 1001-4330
年卷期: 2023 年 60 卷 004 期
页码: 857-864
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]分析研究玉米钙依赖蛋白激酶全基因组鉴定及抗旱表达.[方法]使用NCBI Blast、DNAMAN和MotifScan等程序分析玉米钙依赖蛋白激酶CDPK的蛋白结构域和系统发育.采用Real-time RT-PCR方法分析CDPK基因在干旱胁迫处理玉米幼苗中的表达,评价CDPK基因对玉米干旱胁迫反应能力.[结果]鉴定出了在玉米中含有39 个CDPK基因.将CDPK基因分为4 个组.每个群体中的成员有共同的蛋白质基序和外显子及内含子结构,共同的进化起源.39 个玉米CDPK基因根据它们的系统发育关系分组,并锚定在特定的玉米染色体上.多数CDPK基因在玉米干旱胁迫中的表达水平发生改变,CDPK基因参与对干旱胁迫的响应.[结论]从玉米基因组数据库中鉴定出了39 个CDPK基因,大多数玉米CDPK基因在不同组织和不同发育阶段表现出不同的表达水平,CDPK基因在玉米发育中发挥不同的作用.多数CDPK基因在干旱胁迫下的表达量均发生变化.
分类号: S188
- 相关文献
[1]高粱LBD基因家族的鉴定及苗期干旱胁迫表达分析. 宋迎辉,付森杰,朱灿灿,代书桃,秦娜,景雅,张真,薛淑霞,李君霞. 2024
[2]全基因组水平白花草木樨TCP基因家族的鉴定及在干旱胁迫下表达模式分析. 李艳鹏,魏娜,翟庆妍,李杭,张吉宇,刘文献. 2023
[3]穿心莲NAC基因家族的鉴定与表达分析. 徐世强,李静宇,孙铭阳,顾艳,王继华. 2024
[4]谷子GRAS转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及标记开发. 王智兰,韩康妮,杜晓芬,李禹欣,连世超,王军. 2022
[5]杧果DBB基因鉴定及其在胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌侵染过程中的表达分析. 孙宇,刘志鑫,叶子,高爱平,罗睿雄,蒲金基,张贺. 2021
[6]杧果Whirly基因鉴定及其在病菌侵染过程中的表达分析. 孙宇,刘志鑫,叶子,罗睿雄,蒲金基,张贺. 2021
[7]茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析. 齐香玉,李新茹,陈双双,冯景,陈慧杰,金玉妍,苗艳华,邓衍明. 2024
[8]辣椒Whirly基因家族的鉴定及表达分析. 吕艳艳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,郑小兰,姜俊,李艳,张梦园,姚秋菊,张强,张晓伟. 2019
[9]栽培种花生LEA蛋白基因家族的鉴定及其低温胁迫下表达分析. 付娆,李佳佳,单燕,张海洋,衣葵花,修妤,梁晓艳,张佳蕾. 2022
[10]杧果RAV基因家族的全基因组分析. 孙宇,刘志鑫,叶子,罗睿雄,刘晓妹,蒲金基,张贺. 2021
[11]油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析. 周丽霞,赵志浩,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022
[12]葡萄OPR基因家族全基因组鉴定及重金属胁迫下的表达分析. 游双红,谭平,史文景,武峥,陈元平,伊洪伟,周广文. 2021
[13]猕猴桃蔗糖合成相关酶SUS与SPS基因的鉴定与表达分析. 刘春晓,蔡恒,张涛,朱海军,钱亚明. 2024
[14]西瓜TPS家族基因的鉴定、分类与分析. 孙梦利,徐子健,王世豪,江雪飞,孙化鹏,乔飞. 2018
[15]高粱GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 宋迎辉,朱灿灿,代书桃,秦娜,王春义,张真,李君霞,平西栓. 2022
[16]芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析. 李魁印,段丽丽,胡云,李伟,付文苑,杨巍,唐兵,常向彩. 2025
[17]玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析. 王延召,周波,韩小花,黄保,鲁晓民,程军玲,王淑凤,聂利红. 2020
[18]SbSBP5基因参与高粱对干旱胁迫的响应. 常建忠,董春林,张正,杨睿,蒋丹,张一中,张彦琴,杨丽莉,闫凤霞. 2019
[19]木薯MeHSF7基因克隆及表达分析. 曾坚,廖凤凤,吴春来,胡伟. 2020
[20]西葫芦9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶CpNCED2基因的克隆及其干旱响应模式研究. 刘建汀,曾美娟,温文旭,王彬,陈敏氡,叶新如,朱海生,温庆放. 2021
作者其他论文 更多>>
-
西北春麦区试品种稳定性及适应性综合评价
作者:王春生;赵准;夏建强;时佳;高新;王重;张跃强
关键词:AMMI模型;GGE双标图;春小麦;稳定性;适应性
-
基于无人机多光谱NDVI值估测玉米产量
作者:张磊;姚梦瑶;刘志刚;李娟;杨洋;蔡大润;陈果;李波;李晓荣;陈勋基;翟云龙
关键词:玉米;产量;归一化植被指数(NDVI);偏最小二乘回归(PLSR)
-
玉米ZmMPI基因克隆及其过表达转基因株系检测
作者:姚梦瑶;李娟;刘志刚;蔡大润;李晓荣;李波;杨洋;王子轩;王勇攀;陈勋基;耿洪伟;陈果
关键词:玉米;ZmMPI;盐碱胁迫;转基因植株;鉴定
-
玉米穗发芽突变体vp2的基因克隆及功能研究
作者:张馨月;秦阳;李瑞;黄全生;王逸茹;郑军
关键词:玉米;穗发芽;植物激素;脱落酸
-
陆地棉环核苷酸离子通道蛋白基因GhCNGC8克隆及初步表达分析
作者:赵准;胡文冉;邵武奎;黄全生
关键词:棉花;GhCNGC8;基因克隆;表达分析;载体构建
-
棉花陆海渐渗杂交群体纤维品质性状的QTL定位
作者:马君;杨延龙;师维军;汪鹏龙;郑巨云;郭仁松;胡文冉;杨洋
关键词:棉花;陆海渐渗系;纤维品质;SSR标记;QTL定位
-
陆地棉TCP家族基因鉴定及组织表达分析
作者:胡文冉;赵准;邵武奎;黄全生
关键词:陆地棉;TCP基因;基因家族鉴定;生物信息学;特异性表达