甘蔗MAP激酶基因SoMAPK4克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李粲

作者： 滕峥;刘开雨;桑洪玉;卢双楠;方位宽;梁朝旭;刘晓静;何姗珊;刘芳;邱永福;李鸣;李容柏

作者机构：

关键词： 甘蔗;MAP;基因克隆;SoMAPK4;生物信息学

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2012 年 43 卷 06 期

页码： 11-16

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】克隆甘蔗MAP激酶家族新基因的全长序列,为了解甘蔗抗逆胁迫机制提供依据。【方法】以新台糖22为材料,提取甘蔗幼叶总RNA并反转录为cDNA;利用已知物种MAP激酶基因核苷酸序列保守区设计引物,采用5'和3'端RACE技术克隆新基因全长,并进行生物信息学分析。【结果】克隆获得的甘蔗新基因与玉米ZmMAPK4同源性很高,达92.6%,将该基因命名为SoMAPK4(登录号JQ062930),基因全长1499bp,其中开放阅读框(ORF)为1128bp,5'非翻译区(UTR)为218bp,3'非翻译区(UTR)为213bp。生物信息学分析结果表明,SoMAPK4基因编码一个含376个氨基酸的蛋白质,分子量约43.5kDa,等电点为5.51,含有11个保守的蛋白激酶亚区和MAP激酶的磷酸化位点TEY基序。【结论】克隆获得甘蔗MAP激酶新基因SoMAPK4,该基因可能参与多种胁迫反应的信号传递,是研究甘蔗非生物胁迫和生物胁迫过程中信号传递的一个关键因素。

分类号： S566.1

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