硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姚运法

作者： 姚运法;练冬梅;林碧珍;赖正锋;洪建基

作者机构：

关键词： 冰菜;转录组;差异表达基因;植物激素信号转导途径

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 2737-2747

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理（10 mmol/L）导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理（100 mmol/L）SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理（10 mmol/L）促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理（10 mmol/L）对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理（10 mmol/L）表达量无上下调表达,硒处理（100 mmol/L）TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。

分类号： S649

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