椰子GA代谢途径相关基因的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 何贺

作者: 何贺;夏薇;王永;张大鹏;石鹏;肖勇

作者机构:

关键词: 椰子;赤霉素代谢途径;生物信息学

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 20 卷 016 期

页码: 5290-5298

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 赤霉素(GAs)对植物生长发育具有重要的调控作用,本研究通过生物信息学方法对椰子GA代谢途径通路上有关基因的理化性质以及组织特异性表达进行分析,筛选出GA代谢相关基因45个,并对其结构、功能进行了预测.通过亚细胞定位分析发现,椰子GA代谢通路基因存在于细胞核、线粒体,且有功能蛋白翻译,这与GA代谢通路上相关蛋白的调控功能吻合.通过表达量数据分析发现在椰子不同组织中GA代谢相关基因的表达量存在差异,其中CnDELLA家族、CnGID1受体家族、CnFbox、CnSPY家族成员基因在胚、胚乳和胚愈伤组织中表达,表明其与幼苗期的生长发育有关,在椰子早期发育过程中可能存在DELLA蛋白的抑制作用.椰子GA代谢途径通路上相关基因研究对海南本地高、矮种育种的研究具有重要意义,通过对GA代谢途径通路上相关基因对比分析,为之后的研究提供理论支持.

分类号: S667.4

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