茶树CsActin1基因密码子偏性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵洋

作者： 刘振;杨培迪;成杨;杨阳

作者机构：

关键词： 茶树(Camellia sinensis);肌动蛋白;密码子偏性

期刊名称： 茶叶通讯

ISSN： 1009-525X

年卷期： 2014 年 41 卷 04 期

页码： 13-17

摘要： 运用CUSP、Codon W、CHIPS程序分析茶树肌动蛋白基因Cs Actin1的密码偏性,并将其与茶树基因组密码子偏性比较,以及与其它9种植物肌动蛋白基因进行基于密码子偏性和CDS序列的聚类分析。结果显示,Cs Actin1相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸的密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子,肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果虽存在差异,但都能在一定程度上反映物种间的亲缘关系。

分类号： S571.1

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