利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位

文献类型: 中文期刊

第一作者: 周小静

作者: 周小静;董洋;张芳;任小平;陈玉宁;黄莉;陈伟刚;廖伯寿;雷永;晏立英;罗怀勇;姜慧芳

作者机构:

关键词: 花生;出仁率;QTL定位;SNP标记图谱;meta-QTL分析

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2016 年 38 卷 06 期

页码: 750-756

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%~13.77%,LOD值介于2.59~7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cq SPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。

分类号: S565.2

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