5种常见犬腹泻病毒基因芯片检测方法的建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏霞

作者： 苏霞;周宏专;常彦嫣;齐颀;林路路;张进;徐福洲;杨兵

作者机构：

关键词： 犬腹泻病毒;基因芯片;诊断

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2019 年 08 期

页码： 2211-2219

收录情况： 北大核心

摘要： 为建立一种简便、快速、高效的可同时区分犬腺病毒1型(canine adenovirus type 1,CAV-1)、犬腺病毒2型(canine adenovirus type 2,CAV-2)、犬冠状病毒(canine coronavirus,CCV)、犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)、犬细小病毒(canine parvovirus,CPV) 5种常见犬腹泻病毒的基因芯片诊断方法,本研究以CAV-1、CAV-2、CCV、CDV、CPV 5种犬腹泻病毒为靶病毒,根据NCBI上收录的病毒基因序列在其保守区域内设计引物,在此基础上根据变异区域设计针对每种病毒的探针2～3条,优化检测体系的各反应条件,确定该检测方法的特异性与敏感性,建立可同时区分5种病毒的基因芯片检测方法。结果显示,建立的基因芯片检测方法可同时检测以上述5种犬腹泻病毒,其中PCR的退火温度为55℃、延伸时间为1 min 15 s;探针与PCR产物的杂交温度40℃、杂交时间2.5 h时,该方法对CAV-1、CAV-2、CCV、CDV和CPV 5种病毒标准品的检测限分别为0.2 fg/μL、2 fg/μL、2 fg/μL、20 pg/μL和0.02 fg/μL,具有较高的灵敏性;同时对犬副流感病毒进行特异性试验,发现无阳性信号出现,具有较强的特异性;对14份临床腹泻样品检测结果显示,基因芯片方法对CAV-1、CAV-2、CCV、CDV和CPV 5种病毒的阳性检出率分别为28.57%、50.00%、64.28%、14.28%和85.71%,并且基因芯片检测方法的敏感性较PCR要高10～100倍。以上结果表明,本研究建立的基因芯片检测方法具有特异、敏感等特点,对临床中犬类混合感染病毒检测具有一定的诊断意义。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析. 刘影,徐文静,杜茜,杨信东,李启云. 2010

[2]民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索. 杨月莹,刘娣. 2013

[3]稻瘟病菌胁迫下水稻miRNA的表达. 姜兆远,任金平,刘晓梅,夏海丰,洪德志,高玮,袁媛. 2013

[4]基因芯片在现代畜牧业的应用研究进展. 王晓薇,马青. 2015

[5]利用基因芯片分析小麦茎秆伸长过程中的基因表达谱. 王创云,吴曦,王陆军,赵丽,侯雅静,李海燕. 2012

[6]犬猫3种冠状病毒基因克隆的构建与芯片检测技术. 李健,熊炜,陈沁,王权,王巧全,张建武,胡永强,李树清. 2008

[7]水稻淡黄叶突变体安农标810S基因表达量的初步研究. 王国槐,青先国,郭清泉,宋克堡,李必湖,严明理. 2007

[8]表面等离子体谐振(SPR)技术在水稻垩白基因Chalk5检测中的应用. 汪雪峰,辛业芸. 2018

[9]水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析. 姜兆远,任金平,刘晓梅,邹晓威,郭晓莉,王继春,温嘉伟,刘文平,夏海丰,洪德志. 2013

[10]基因芯片技术及其在植物上的应用. 高强,刘谋益. 2003

[11]错分风险最小化特征搜索猪抗寒性状相关基因. 杨月莹,刘娣,丁常宏,祁雪莲. 2013

[12]利用Affymetrix芯片分析民猪冷应激后肌肉组织的基因表达谱. 张冬杰,刘娣,别墅,孙洪涛,汪亮,王文涛,何鑫淼. 2011

[13]狂犬病诊断基因芯片的建立和检测应用的初步研究. 张伟,吴时友,尹燕博,牛钟相,张秀美. 2008

[14]荧光定量PCR技术检测花生种皮抗黄曲霉基因表达强度. 张廷婷,李春娟,闫彩霞,孙兵,郑奕雄. 2012

[15]药用植物在生物技术领域中的研究及应用. 孙科,杨培,闫微. 2007

[16]扩展莫尼茨绦虫基因芯片的制作及分析. 张慧,赵文娟,薄新文,王新华,李娜. 2010

[17]狂犬病病毒低密度基因芯片的建立及其与常规检测方法的比较研究. 张伟,吴时友,尹燕博,张秀美. 2007

[18]致鸡产蛋下降禽病原的检测基因诊断芯片的研制及临床应用. 张伟,任素芳,田振宇,郑彤彤,张秀美,徐怀英. 2010

[19]应用基因芯片分析短日低温条件下新型粳稻光温敏核质互作不育系育性相关基因. 杜士云,阳菁,王守海,王德正,吴爽,罗彦长,李阳生. 2010

[20]基因芯片技术及其在植物中的应用. 袁文龙,康占海,陶晡,赵春辉,霍建飞,耿硕. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序