GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 唐月异

作者： 唐月异;张建成;王秀贞;崔凤高;王传堂

作者机构：

关键词： 花生;SNP;频率;GenBank

期刊名称： 花生学报

ISSN： 1002-4093

年卷期： 2010 年 39 卷 02 期

页码： 21-23

摘要： 下载GenBank数据库中已公布的花生栽培种基因组DNA序列1718条及EST序列85797条,利用DNAStar软件进行叠连群构建,基因组DNA序列构建叠连群161个,长度共计152940bp,直接鉴定出候选SNP位点5496个,SNP平均出现频率为3.59%;EST序列构建10990个叠连群,长度共计10477241bp,由三条及三条序列以上构成的叠连群的总长度为6524329bp,发现候选SNP位点307179个,SNP平均出现频率为4.71%。

分类号： S565.2

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