森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周厚成

作者： 周厚成;李刚;赵霞;康兆茹;郭蔼光

作者机构：

关键词： 草莓;MADS-box;转录因子;生物信息学;FaMADS1基因

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2014 年 11 期

页码： 1630-1638

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基酸残基,有21个Fv MADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布;68个Fv MADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为"RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF"。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了Fa MADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族,c DNA全长1 167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。

分类号： S668.4

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