水稻抽穗期控制候选基因的SNP/InDel多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 闫双勇

作者： 闫双勇;谭振波;刘学军;苏京平;马忠友;孙林静;卢百关

作者机构：

关键词： 水稻;抽穗期;侯选基因;单核苷酸多态性(SNP)

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2005 年 3 卷 03 期

页码： 335-341

收录情况： CSCD

摘要： 抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚。本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因。利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820个SNP及191个InDel位点。分析表明,这些位点不是平均分布到每个基因上。SNP/InDel含量较高的基因存在SNP/InDel的热点片段。14.1%的SNP位点,及7%的InDel位点分布在基因的编码区。本文也分析了侯选基因侧翼5Kb范围内的SNP/InDel多态性位点。按照侧翼多态性位点数目的分布可以将侯选基因分成4种类型,即两侧保守型、两侧热点型、单侧热点型、一侧热点一侧保守型。

分类号： S511

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