苹果β-微管蛋白基因家族鉴定及表达特性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄慧玲
作者: 黄慧玲;王延翔;王悦;宁芹芹;李明;郝鹏博;丛柳;白团辉;史江莉;焦健;王苗苗;刘昱;赵玉洁;万然;申亚文;张恒涛;张坤玺;郑先波
作者机构:
关键词: 苹果;微管蛋白;基因家族;矮生
期刊名称: 果树学报
ISSN: 1009-9980
年卷期: 2025 年 42 卷 004 期
页码: 693-706
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】鉴定苹果β-微管蛋白家族基因,并探究其差异表达模式,为进一步开展苹果微管蛋白的功能研究提供理论基础。【方法】基于苹果基因组数据库鉴定苹果β-微管蛋白家族成员,并对苹果β-微管蛋白家族基因进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析其在苹果不同砧木类型及不同组织中的表达模式。【结果】苹果基因组中有13个苹果β-微管蛋白家族成员,随机分布在11条染色体上,通过进化树分析可将其聚为5个亚组;多序列比对和基因结构分析表明苹果β-微管蛋白家族有较强的保守性;通过启动子顺式作用元件分析发现脱落酸响应元件、茉莉酸甲酯响应元件和厌氧诱导元件在苹果β-微管蛋白家族基因启动子中分布最为广泛。苹果β-微管蛋白家族基因存在一定的组织表达特异性,且MdTUB4在矮化砧木中的表达量显著低于乔化砧木,而MdTUB12表达趋势相反,表明了MdTUB4和MdTUB12可能参与调控苹果矮生。【结论】鉴定了13个β-微管蛋白家族基因,分析了其在苹果矮生中的差异表达特性,为进一步研究微管蛋白调控苹果矮生提供了理论基础。
分类号: S661.1
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