高山杜鹃转录组测序及MYB转录因子家族分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾新平

作者： 贾新平;刘晓青;邓衍明;李畅;苏家乐

作者机构：

关键词： 高山杜鹃;转录组;MYB转录因子

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 021 期

页码： 7037-7047

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： MYB转录因子是植物中最大的一类转录因子家族,参与调控植物的生长发育、次生代谢、逆境胁迫等生物学过程。目前,关于高山杜鹃MYB转录因子的研究尚未见报道。本研究利用SMRT高通量测序技术对高山杜鹃品种‘富丽金陵’进行转录组测序,得到了15.37 Gb数据,通过去冗余获得75 002条转录本序列。其中,71 155、33 653、30 359条转录本分别在NR、GO、COG数据库中具有匹配信息。基于高山杜鹃转录组数据,鉴定了64个转录因子家族,其中MYB基因有220个。根据结构特性将MYB基因分为4类:1R-MYB、R2R3-MYB、R1R2R3-MYB和4R-MYB,其氨基酸序列包含20种保守元件。进化树分析结果显示,高山杜鹃MYB基因分为28个亚组。研究采用单分子实时测序技术（single molecule real time, SMRT）对高山杜鹃品种‘富丽金陵’转录组进行测序,将获得的转录本序列进行功能注释和分类,对获得的220个MYB基因进行生物信息学进行分析,相关结果具有一定参考意义。

分类号： S685.21

  • 相关文献

[1]银杏MYB转录因子的鉴定及特征分析. 石晓雯,孙岩,丁娜,孙惠英,王婷,贾小云,李润植. 2017

[2]基于大豆叶枕响应叶柄角变化转录组的MYB基因分析. 常玮,王娟,郑清岭,张彦威,陈吉宝. 2024

[3]基于转录组信息的杜梨盐胁迫相关MYB转录因子鉴定与分析. 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,常有宏,蔺经. 2024

[4]利用SPAD-502对高山杜鹃氮素营养的快速诊断研究. 蔡艳飞,李世峰,李树发,解玮佳,宋杰. 2014

[5]IBA浓度和使用方法对高山杜鹃‘Nova Zembla’扦插生根的影响. 蔡艳飞,宋杰,李世峰,李树发. 2018

[6]不同LED光质对两种黄花高山杜鹃组培增殖和生根的影响. 廖多思,彭绿春,林开文,解玮佳,宋杰,李世峰,瞿素萍. 2019

[7]高山杜鹃离体叶片高效再生及其再生途径研究. 彭绿春,廖多思,解玮佳,宋杰,蔡艳飞,张露,李世峰. 2021

[8]18个高山杜鹃品种在滇中地区的生长适应性. 陈婷,李世峰,瞿素萍,钱兴,刘杰,解玮佳. 2019

[9]高山杜鹃新品种‘富丽金陵’. 刘晓青,苏家乐,李畅,何丽斯,陈璐. 2011

[10]不同铵硝比对高山杜鹃侧枝生长和生理特性影响. 高研,彭绿春,李世峰,解玮佳,宋杰,张露,熊俊芬,赵正雄. 2024

[11]3种植物生长调节剂对高山杜鹃组培苗保存的影响. 李莎莎,李雪娇,赵正雄,解玮佳,李世峰,宋杰,张露,彭绿春. 2022

[12]部分高山杜鹃品种在南京的性状表现及配套栽培技术. 刘晓青,苏家乐,李倩中,沈夏红. 2008

[13]高山杜鹃品种春节催花效应比较. 刘晓青,苏家乐,李畅,何丽斯. 2013

[14]高山杜鹃特征特性及盆栽技术. 鲜小林,万斌,秦帆. 2011

[15]高山杜鹃品种的抗热性评价. 樊玉花,解玮佳,彭绿春,王继华,蔡艳飞,李世峰. 2019

[16]温度与光强对高山杜鹃催花期间花芽营养物质积累的影响. 陈睿. 2015

[17]21个高山杜鹃引进品种的亲本分析. 解玮佳,王继华,卢红春,李树发,彭绿春,蔡艳飞,张露,李世峰. 2015

[18]高山杜鹃成都平原越夏生长研究. 陈睿,胡菊,鲜小林. 2020

[19]8个高山杜鹃杂交F1代的叶片性状遗传分析. 许凤,宋杰,王继华,彭绿春,张露,蔡艳飞,李世峰,解玮佳. 2020

[20]光照条件对高山杜鹃光合生理特性的影响. 王松,蔡艳飞,李枝林,李世峰. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序