茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 齐香玉

作者： 齐香玉;李新茹;陈双双;冯景;陈慧杰;金玉妍;苗艳华;邓衍明

作者机构：

关键词： 茉莉花;TCP基因家族;全基因组鉴定;系统进化分析;表达分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 001 期

页码： 63-71

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨茉莉花TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,基于茉莉花的基因组数据,利用生物信息学方法对茉莉花TCP(JsTCP)基因进行了全基因组鉴定及分析,并分析了TCP基因家族在花发育不同时期和花粉-柱头互作中的表达水平.结果显示,茉莉花全基因组中共鉴定出27个TCP基因家族成员,命名为JsTCP1~JsTCP25,其蛋白包含208~539个氨基酸残基,分子量为22.95~56.96 ku,等电点为5.70~9.97,均为不稳定的亲水性蛋白.亚细胞定位预测结果显示,JsTCPs均位于细胞核内.染色体定位结果显示,JsTCPs不均匀分布在10条染色体上.基因结构分析结果显示,JsTCPs具有1~5个外显子以及0~4个内含子.蛋白保守基序和系统进化分析结果显示,JsTCPs均含保守的TCP结构域,可分为Class Ⅰ和Class Ⅱ 2个亚类.启动子顺式作用元件的分析结果显示,JsTCPs启动子上含有多个植物激素响应、胁迫响应和生长发育相关等元件.表达模式分析结果显示,24个JsTCPs基因在茉莉花花发育不同时期表达,22个基因在花粉-柱头互作中表达.总之,本研究鉴定了27个茉莉花TCP基因家族成员,并发现家族成员在花发育不同时期和授粉后不同时期特异表达.

分类号： S685.03%Q78

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