中国对虾微卫星DNA多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘萍

作者： 刘萍;孟宪红;孔杰;庄志猛;马春艳;王清印

作者机构：

关键词： 中国对虾;地理群体;微卫星DNA;多态性分析

期刊名称： 自然科学进展

ISSN： 1002-0071

年卷期： 2004 年 14 卷 03 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据建立的中国对虾部分基因组文库,对筛选的含微卫星序列的克隆设计了引物,并选择了8对多态性引物对中国对虾进行了分析。实验材料为中国对虾黄渤海群体(HB)、朝鲜半岛西海岸群体(KX)和朝鲜半岛南海岸群体(KN)3个野生群共计60个个体。结果表明:经8对引物对60尾中国对虾进行PCR扩增后,共获得了61个等位基因。对3个野生群体的8个基因位点共计24个群体位点进行了杂合度观测值(HD)和杂和度期望值(He)计算,通过Hardy-Weinberg平衡偏离指数(D)检验,发现有5个群体位点处于杂合子缺失状态,其中HB群体有3个群体位点杂合子缺失。KC和KN群体各有1个群体位点杂合子缺失。其次,对中国对虾3个野生群体遗传分化指数F_(st)值进行了计算,两两群体之间的F_(st)值均小于0.05,说明中国对虾3个野生群体的遗传分化较弱。P检验也说明了这个结果,即3个群体的中国对虾遗传分化不显著,有99.27％的遗传变异是来自个体之间,只有0.73％的遗传变异是来自群体之间。最后,经过聚类分析,发现HB群体和KX群体的亲缘关系较近,而KN群体与前两者亲缘关系较远。实验还对8对微卫星引物的多态性信息含量(PIC)进行了评估,PIC值介于0.5984～0.9178之间,揭示了这8个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。

分类号： S917

  • 相关文献

[1]中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄、渤海3个野生地理群遗传多样性的微卫星DNA分析. 刘萍,孟宪红,何玉英,孔杰,李健,王清印. 2004

[2]微卫星技术对黄、渤海海域7个不同地理群体中国对虾的遗传结构和遗传分化研究. 孟宪红,孔杰,王清印,刘萍. 2008

[3]3个仿刺参地理种群遗传变异的微卫星DNA分析. 谭杰,孙慧玲,刘萍,杨爱国,燕敬平,刘志鸿,周丽青. 2007

[4]中国对虾部分基因组文库构建和微卫星DNA序列的筛选. 刘萍,孟宪红,孔杰,李健,王清印. 2004

[5]魁蚶4个地理群体ITS序列变异及系统发生分析. 周丽青,杨爱国,王清印,吴彪,于涛. 2012

[6]大菱鲆4个引进地理群体遗传多样性的微卫星分析. 侯仕营,马爱军,王新安,黄智慧,薛宝贵,杨志,曲江波. 2011

[7]日本蟳4个地理群体遗传变异的同工酶分析. 丁金强,刘萍,李健,王清印,高保全,陈萍. 2013

[8]不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析. 闻奋亮,王银海,赵莲,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2017

[9]梭鱼(Liza haematocheila)4个野生地理群体遗传多样性的微卫星分析. 毛守康,马爱军,丁福红,闫喜武,罗海忠,李伟业,徐宝荣,王怀忠,王宝义. 2016

[10]基于GLM模型Logistic回归的菲律宾蛤仔地理群体判别. 董建宇,胡成业,杨晓龙,李文涛,张秀梅. 2018

[11]应用AFLP技术分析多鳞四指马鲅不同地理群体的遗传多样性. 杨阳,汤滔,张涛,侯俊利,宋超,王妤,张琴星,庄平. 2013

[12]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)不同地理群体的生化遗传分析. 李吉涛,段亚飞,李健,陈萍,刘萍,高保全. 2013

[13]渤海、黄海及东海近海五个银鲳地理群体的形态变异. 赵峰,庄平,章龙珍,施兆鸿. 2011

[14]基于线粒体COI基因的6个黄鳝群体遗传多样性. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟. 2018

[15]北黄海虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)定居群体的生态适应性研究. 杨钰,倪守胜,刘毅,柳淑芳,庄志猛. 2017

[16]大银鱼不同地理群体的形态差异与判别分析. 周彦锋,徐东坡,方弟安,尤洋. 2016

[17]多鳞四指马鲅4个地理群体的形态差异. 杨阳,庄平,张涛,侯俊利,赵峰,黄晓荣,汤滔. 2013

[18]基于AFLP的海萝野生群体遗传多样性分析. 郭奕惠,范嗣刚,陈素文,喻达辉,吴进锋,陈利雄,朱长波,郭永坚. 2015

[19]银鲳4个地理种群遗传多样性的初步研究. 孟彦羽,章龙珍,赵峰,施兆鸿,庄平. 2009

[20]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序