猪黑皮质素受体1基因密码子偏好分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖红卫

作者： 肖红卫;刘西梅;郑新民;华文君;李莉;张立苹;毕延震;华再东

作者机构：

关键词： 家猪;黑皮质素受体1基因;密码子偏好;聚类分析

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2013 年 09 期

页码： 95-100

摘要： 遗传密码子是生命信息的基本遗传单位,每种氨基酸对应1~6个同义密码子。特定物种在长期进化中形成了适应自身基因环境的密码子使用偏好。运用CHIPS、CUPS和CodonW程序分析猪黑皮质素受体1基因密码子偏好,并与牛、羊、小鼠、人等多种动物的黑皮质素受体1基因密码子偏好进行比较,以期为转基因动物育种提供依据。结果表明,猪偏好使用以C、G结尾的密码子(96.88%),且在整个编码区序列中G+C含量(67.81%)大于A+T(32.19%),该基因在猪体内表达水平很高(CAI=0.849),并且发现,猪的密码子偏好性与牛、犬等动物类似,明显不同于鲀、雀、獾、大猩猩等动物。要实现目的基因在猪MC1R基因中进行定点整合并成功表达和尽可能地提高其表达量,需对目的基因的部分密码子进行改造。

分类号： S828

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