滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张晓东

作者: 张晓东;李彩霞;王连春;王元忠

作者机构:

关键词: 滇龙胆;乙酰CoA酰基转移酶;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2016 年 44 卷 06 期

页码: 94-98

收录情况: 北大核心

摘要: 根据滇龙胆转录组乙酰CoA酰基转移酶基因GrAACT序列设计引物,使用逆转录PCR(RT-PCR)技术从滇龙胆幼叶扩增该基因,并进行序列分析、原核表达和组织特异性分析。结果表明:GrAACT基因(登录号KJ917163)开放阅读框长1 215 bp,编码404个氨基酸;GrAACT蛋白相对分子质量41.41 ku,p I值为6.25,属于AACT蛋白家族成员,无信号肽,为疏水稳定蛋白,主要由α-螺旋、无规则卷曲构成;GrAACT蛋白具有AACT蛋白保守结构域:硫解酶N端结构域(第12~272位氨基酸)、硫解酶C端结构域(第282~402位氨基酸)、类硫解酶结构域(第13~403位氨基酸);在硫解酶C端结构域中,包含硫解酶保守位点(第350~366位氨基酸)、硫解酶活性位点(第385~398位氨基酸);滇龙胆GrAACT蛋白与长春花CrAACT蛋白亲缘关系最近;GrAACT基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为67.41 ku;组织特异性表达分析结果表明,GrAACT基因主要在茎、根中表达。

分类号: S567.239

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