玉米生长素应答因子ARF基因家族的全基因组鉴定及表达特征分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 马晨晨
作者: 马晨晨;叶飞宇;张晓东;胡德升;田艳雨;孙文鑫;李果;邓亚洲;曹丽茹
作者机构:
关键词: 玉米;生长素响应因子;生物信息学;表达模式
期刊名称: 种子
ISSN: 1001-4705
年卷期: 2025 年 44 卷 010 期
页码: 11-20,36
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 干旱胁迫是制约玉米生产的关键非生物逆境因素之一。为了探究玉米生长素应答因子(ARF)在响应干旱胁迫过程中的生理功能及作用机制,以玉米品种郑8713为试验材料,基于全基因组分析,对玉米ARF基因家族成员进行了鉴定和生物信息学分析,并利用RT-qPCR技术分析了相关基因在干旱胁迫条件下的表达模式。结果表明,在玉米基因组中共鉴定出28个ARF基因。理化性质分析显示,ARF蛋白的氨基酸数为511~1 152个,等电点范围为5.70~8.08,均为亲水性且不稳定的蛋白质。亚细胞定位预测结果表明,28个ZmARF家族成员均定位于细胞核内。系统发育分析发现,玉米ARF家族成员可划分为5个亚族,且多数基因与高粱和水稻具有较高的同源性。保守结构域分析表明,所有ARF蛋白均含有Auxin_resp和B3保守结构域,其启动子区域富含脱落酸响应元件和茉莉酸甲酯响应元件。组织特异性表达分析表明,28个ZmARF基因在检测的组织中均有表达,且同一亚家族基因的表达模式较为相似。干旱胁迫下的表达特性分析显示,大多数ZmARFs在受到干旱胁迫时表达量显著增加或降低。
分类号: S513
- 相关文献
[1]玉米生长素响应因子基因ZmARF10在干旱胁迫中的功能分析. 曹丽茹,叶飞宇,李伟亚,马晨晨,庞芸芸,梁小菡,张新,鲁晓民. 2024
[2]玉米生长素响应因子基因家族全基因组鉴定及表达分析. 曹丽茹,张前进,郭子宁,鲁晓民,张新,魏昕,皇甫柏树,王振华. 2021
[3]烟草NtMLO家族全基因组序列鉴定及表达分析. 张孝廉,张吉顺,余世洲,余婧,赵德刚. 2019
[4]白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析. 易丹,王博,段慧荣,李毅,王丽蓉. 2021
[5]菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析. 张婷,张双喜,裴丽丽,于太飞,陈明,李连城,周永斌,马有志,徐强. 2014
[6]可可毛色二孢全基因组分泌蛋白的预测及分析. 邢启凯,李铃仙,曹阳,张玮,彭军波,燕继晔,李兴红. 2020
[7]西方蜜蜂Sirtuin蛋白家族基因鉴定及表达分析. 宋文菲,刘娜,苗春辉,余玉生,胡宗文,王艳辉,李亚辉. 2023
[8]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析. 张海晨,李彩霞,王元忠,张晓东. 2016
[9]雷蒙德氏棉DnaJ蛋白的生物信息学预测及盐胁迫下的表达分析. 徐珍珍,郭琪,刘静,徐鹏,张香桂,沈新莲. 2015
[10]茶尺蠖水通道蛋白EoAQP1的cDNA克隆、多克隆抗体制备及亚细胞定位. 李良德,王定锋,刘丰静,李慧玲,张辉,吴光远. 2016
[11]棉花抗细胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表达分析. 龚文芳,喻树迅,宋美珍,范术丽,庞朝友,肖水平. 2010
[12]亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王园园,赵春月,孙润润,秦腾飞,张金宝,郑巨云,杨秋月,翟勇全,孙家良,王清连. 2021
[13]黄瓜AP2/ERF基因家族全基因组鉴定及表达模式分析. 杨巍,赵丽芬,杨娟,李飞,王天文,邓英. 2024
[14]花生YABBY基因家族的鉴定与表达分析. 张万年,牛海龙,王伟,刘红欣,李伟堂,李玉发. 2025
[15]黄瓜
[16]陆地棉gag基因家族的鉴定与分析. 王旭明,赵夏夏,布热比亚·亚合普,翟亚巍,杨高峰,郭志刚,马云珍,张友平. 2025
[17]广西黄牛FGF2基因克隆、生物信息学分析及其在卵泡中的表达研究. 王云,郑彦梓,唐振华,王燕新,贾茹茹,韦春烨,周东平,卢瑛,黄荣春,石德顺,陆凤花. 2025
[18]甘薯WRKY基因家族鉴定及其响应茎腐病侵染的表达分析. 丁夏威,田沺,陈健文,陈景益,王章英,邹宏达,黄立飞. 2024
[19]应用实时荧光定量PCR技术分析玉米水分胁迫诱导基因的表达模式. 张中保,李会勇,石云素,宋燕春,黎裕,王天宇. 2007
[20]10个玉米ZmbZIP基因表达模式分析. 贾利强,吴洪梅,曾科美,龙金云,郑飞,赵秋芳,陈曙. 2021
作者其他论文 更多>>
-
多级调控下的大豆割台高度控制系统设计与试验
作者:任桂英;古愉川;李平;冯伟;张先锋;曹中华;周晓晖;李英;李果
关键词:小型联合收割机;大豆割台;仿形机构;高度控制;多级调控
-
转录因子ZmMYB153通过ABA信号调节气孔运动增强玉米苗期抗旱性
作者:张建鹏;王国瑞;别海;叶飞宇;马晨晨;梁小菡;鲁晓民;尚霄丽;曹丽茹
关键词:玉米;MYB;干旱;气孔;ABA
-
高效降解土壤甲基二磺隆菌株的筛选、鉴定及特性
作者:张晓东;刘赵磊;贺文星;田甜甜;吴仁海;徐淑霞
关键词:甲基二磺隆;香茅醇假单胞菌;降解途径;生态结构活动关系模型;毒性
-
玉米苯丙氨酸解氨酶(PAL)家族基因分析及ZmPAL5的功能研究
作者:曹丽茹;叶飞宇;库丽霞;马晨晨;庞芸芸;梁小菡;张新;鲁晓民
关键词:玉米;苯丙氨酸解氨酶;ZmPAL5;抗旱性;生理生化
-
玉米逆境胁迫响应基因ZmbZIP15的克隆与抗旱功能分析
作者:曹丽茹;叶飞宇;庞芸芸;马晨晨;张新;王振华;鲁晓民
关键词:玉米;bZIP;非生物胁迫;抗旱性;亚细胞定位
-
玉米生长素响应因子基因ZmARF10在干旱胁迫中的功能分析
作者:曹丽茹;叶飞宇;李伟亚;马晨晨;庞芸芸;梁小菡;张新;鲁晓民
关键词:玉米;生长素响应因子;非生物胁迫;抗旱性;表达模式
-
基于HJ-1星和GF-1号影像融合特征提取冬小麦种植面积
作者:张宏;李卫国;张晓东;卢必慧;张琤琤;李伟;马廷淮
关键词:HJ-1/CCD卫星影像;GF-1/PMS卫星影像;冬小麦种植面积;特征提取;影像融合;面向对象分类
