鸡传染性支气管炎病毒LX4株mRNA_5和mRNA_6 cDNA的分子特征
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘胜旺
作者: 刘胜旺;杜恩岐;孔宪刚;杨增岐
作者机构:
关键词: 传染性支气管炎病毒;mRNA_5和mRNA_6;cDNA;分子特征
期刊名称: 中国病毒学
ISSN: 1003-5125
年卷期: 2003 年 03 期
页码:
收录情况: CSCD
摘要: 本研究参照已发表的IBV基因序列设计合成了一对引物,经反转录-聚合酶链式反应(Reverse Transcription-polymerase Chin Reaction,RT-PCR)技术扩增得到我国地方分离株LX4 mRNA_5和mRNA_6的全部cDNA大小约1.7kb的片段。将该片段克隆并进行序列测定,与国内外部分参考毒株的相应序列比较分析发现:LX4 5a基因与已发表的国内外IBV毒株之间同源性很低,而这些参考毒株间5a基因同源性却很高(推导的氨基酸同源性在90%以上)。5b基因与国内分离株D971同源性最高。在所选的12株参考毒株中,LX4 N基因推导氨基酸同源性与国内分离株SD/97/02最高(94%),与HB次之(93%),与其他毒株核苷酸和推导氨基酸同源性在89%和92%以下。对已报道的N基因所编码蛋白的三个保守碱性区同源性比较发现,LX4在第66-88位与Beau、M41、H52及FIB同源性均为100%。在第181-234位,推导氨基酸同源性与SD/97/02最高(94%)。在第334-373位推导氨基酸同源性与H120和ZJ971推导氨基酸同源性均为93%,与其他毒株在82%以下。同时还发现在c末端350-409位,LX4与H120推导氨基酸的同源性为100%,与HB次之(98%),与其他毒株在95%以下。以上研究结果提示:我国地方分离毒株LX4 mRNA_5和mRNA_6 cDNA序列与国内其他分离株最高,表明与国内其他分离株具有较近的?
分类号: S852.65
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