异常棉NF-YA家族基因鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐珍珍

作者： 徐珍珍;季为;陈祥龙;徐鹏;郭琪;沈新莲

作者机构：

关键词： 异常棉;NF-YA基因家族;生物信息;干旱;表达模式

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2023 年 39 卷 006 期

页码： 1265-1274

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NF-YA转录因子在植物生长发育和逆境响应中扮演重要角色.本研究通过生物信息学手段,分析棉花二倍体野生种异常棉基因组中NF-YA家族基因的数目、染色体分布、系统进化、保守基序、结构、顺式作用元件、表达模式及编码蛋白质的亚细胞定位、理化性质等.结果表明,异常棉NF-YA基因家族(GoanoNF-YA)包含 17 个成员,分布在 10 条染色体上,编码的蛋白质长度为190~603 个氨基酸,理论等电点为7.87~10.07,16 个成员包含3~5 个外显子且编码的蛋白质定位于细胞核.拟南芥和异常棉NF-YA基因在系统进化树上分为 6 类,每类基因在系统进化树上具有相同或相似类型和排列顺序的基序.5 个NF-YA基因在异常棉根、茎、叶和花中广泛表达,15 个NF-YA基因对干旱持续时间有不同程度的响应,11 个NF-YA基因含有干旱响应顺式作用元件MBS.本研究结果为进一步解析异常棉NF-YA家族基因的功能提供了理论依据.

分类号： S562.035.3

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