火龙果F-box基因家族的结构分析及表达鉴定
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王周雯
作者: 王周雯;王猛;丁一;韦双双;谢俊;黄家权;李洪立;胡文斌;汤华
作者机构:
关键词: 火龙果;F-box基因家族;生物信息分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 21 卷 009 期
页码: 2862-2871
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: F-box基因家族作为植物中最大的基因家族之一,在调控植物发育、生殖及非生物胁迫反应等方面,发挥至关重要的作用.本研究以火龙果的自交亲和品种'金都一号'和自交不亲和品种'粗砂'为材料,对火龙果花器官转录组中的F-box基因家族进行鉴定,对与花发育和亲和性识别相关基因亚族的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、基因在染色体的定位、系统进化关系和遗传结构进行分析,通过RT-qPCR分析其在火龙果花器官的不同组织、授粉前后不同时期的基因表达差异.结果表明:火龙果的F-box基因可被分成11个亚群;根据拟南芥UFO基因聚类结果,鉴定出了 10个与花发育相关的火龙果F-box基因,他们的蛋白分子量为40~52 kD,其中70%呈碱性,90%属于不稳定蛋白,80%定位在细胞膜上;10个基因的保守基序组成相似度较高,均含有motif 1;基因系统发育树和遗传结构对比表明,基因的亲缘关系越近,其遗传结构越接近;RT-qPCR验证出8个基因在火龙果在授粉2 h后显著差异表达,HU11G01721基因和HU07G00057基因在自交亲和品种和自交不亲和品种的花授粉时期中存在显著性差异,他们在自交亲和品种中显著上调,表明其与花发育和亲和性识别有关.
分类号: S667.9
- 相关文献
[1]小偃麦异附加系TaTGA4转录因子基因的克隆与生物信息学分析. 牛祖彪,李娜,惠文荣,宋静,黄春丽,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015
[2]动物胃肠道菌群的研究进展. 王津,燕晓翠,韩烨,周志江,刘红星,陈宝永,郑成江,邹旸,范寰. 2017
[3]牦牛miR-378前体克隆及组织表达分析. 纪会,王会,柴志欣,王吉坤,罗晓林,姬秋梅,信金伟,钟金城. 2019
[4]辣椒蔗糖转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 李宁,尹延旭,王畅,王飞,姚明华,范书云. 2024
[5]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021
[6]甘蓝型油菜SnRK基因家族生物信息学分析及其与种子含油量的关系. 唐婧泉,王南,高界,刘婷婷,文静,易斌,涂金星,傅廷栋,沈金雄. 2021
[7]番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析. 郭盼,孔华,王雨,戴云素,贾瑞宗,周瑶,郭安平,纪长绵,马春花. 2023
[8]油棕SAUR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 周丽霞,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022
[9]番茄20S蛋白酶体基因家族鉴定及生物信息学分析. 闫超凡,孙雪梅,钟启文,邵登魁,邓昌蓉,文军琴. 2024
[10]新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定. 杨李玲,郭迎香,位红颖,王萌,方艺菲,朱鹏,姜敬哲. 2022
[11]鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析. 孙恩成,刘春国,侯喜林,刘明,朴范泽. 2009
[12]甘蓝型油菜γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(GCS)基因的克隆及生物信息分析. 贺晓岚,王建伟,陈新宏,李文旭,秦绍钊. 2023
[13]环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响. 李斌,李明玉,杜志烨,汪开顺,肖凯,王鑫,石杨,姬红丽,陈稷,黄进. 2022
[14]椰子GPAT基因家族的鉴定及生物信息学分析. 周倩倩,张照华,弓淑芳,夏志辉. 2024
[15]甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶Bn-HAM2基因的克隆及生物信息学分析. 王建伟,贺晓岚,李文旭,秦绍钊,汤宏,余星. 2022
[16]小麦TaTVP1基因的克隆与表达分析. 马燕斌,李换丽,文晋,王霞,周仙婷,王新胜. 2023
[17]基于转录组的荔枝ARF基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2017
[18]基于转录组的荔枝XTH家族基因的鉴定及分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2019
[19]北方日光温室火龙果引种与栽培. 马洪英,王莅,郭锐,李洪安,张远芳. 2008
[20]火龙果营养研究及开发现状. 谢国芳,周俊良,韩秀梅,张银,杨月. 2013
作者其他论文 更多>>
-
33份火龙果种质果实性状主成分分析及综合评价
作者:张亚琦;何云;李洪立;洪青梅;濮文辉;李琼;胡文斌;刘平武
关键词:火龙果;果实品质;主成分分析;综合评价
-
TVDI与土壤湿度关系的多时间尺度分析与旱情监测
作者:梁守真;王猛;韩冬锐;王菲;王国良;隋学艳
关键词:植被指数;地表温度;干旱;时间尺度
-
比浊法快速测定土壤中速效钾的研究进展
作者:杨张青;辛银平;赵晴;王猛;秦一浪;胡峰;李国强
关键词:比浊法;土壤;速效钾;快速检测
-
河南省智能农机发展现状与对策建议
作者:张杰;陈洪涛;王猛;杨张青;董春红;李国强
关键词:河南省;智能农机;应用现状
-
‘陇核5号’果实发育规律及疏果施肥对坚果品质的影响
作者:王一峰;陈耀年;胡文斌;王明霞;颉敏华;吴小华;赵淑玲;王让军
关键词:核桃;‘陇核5号’;果实发育;经济性状
-
火龙果HubHLH基因家族的全基因组分析及其对冬季补光诱导开花的表达响应
作者:李佳雪;丁一;王猛;李涛;郭攀阳;刘成立;韦双双;黄家权;李洪立;胡文斌;汤华
关键词:火龙果;bHLH基因家族;全基因组;补光诱导开花;基因差异表达
-
大红和无刺黄龙火龙果不同发育阶段果实甜菜色素组分及含量差异分析
作者:胡莺菊;何云;李洪立;洪青梅;濮文辉;李琼;胡文斌
关键词:火龙果;色泽;甜菜色素;组分;相关性分析;主成分分析