利用SSRseq分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵青

作者： 赵青;都真真;李锡香;宋江萍;张晓辉;阳文龙;贾会霞;王海平

作者机构：

关键词： 大蒜;SSRseq;群体结构;遗传多样性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 1397-1408

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用筛选出的24对SSRseq引物对来自世界各地的676份大蒜种质进行遗传多样性、主坐标和群体遗传结构分析。结果表明:24对SSRseq标记在676份种质中共检测到124个多态性位点,平均等位位点数为5.17个,Nei’s多样性指数平均为1.77,Shannon’s信息指数平均为0.62,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.33和0.34。用邻近法将676份资源划分为4类,其中第Ⅰ类包括以来源于亚洲中高纬度为主的186份种质,第Ⅱ类包括以来源于欧洲、中亚和北美洲为主的205份种质,第Ⅲ类包括以亚洲半抽薹类型的资源为主的132份种质,第Ⅳ类包括以来源于亚洲低纬度为主的153份种质。主坐标分析表明,亚洲低纬度地区的种质聚集在第Ⅰ类与第Ⅲ类,亚洲中高纬地区、欧洲、北美洲地区的种质聚集在第Ⅱ类。群体遗传结构分析将种质资源划分为4类,与邻近法聚类分析相似,以来自欧洲、中亚、北美洲为主的种质资源群体基因多样性和Shannon’s多样性信息指数最大,分别为0.3213与0.5933。用邻近法聚类分析与群体遗传结构分析均将382份中国资源划分为4类,分别以华北、华南、蒙新、西南地区种质为主。主坐标分析表明,中国华北、华南地区的种质分布在PC1的两端,表现出较远的亲缘关系。研究结果将为后期大蒜资源的深入评价和品种选育提供重要参考。

分类号： S633.4

  • 相关文献

[1]西南地区小麦抗条锈病种质的遗传多样性及群体结构分析. 陈天青,黄芳,李文贞,蒋选利,王伟,刘冬成,阳文龙,张爱民,张立异. 2015

[2]湖南新田大冠岭野生大豆居群遗传结构与空间分布关系. 赵青松,赵云云,王朋,邓小娟,马启彬,年海,杨存义. 2014

[3]华北生态群普通杏遗传多样性与群体结构分析. 章秋平,刘冬成,刘威生,刘硕,张爱民,刘宁,张玉萍. 2013

[4]基于分型测序技术的粒用高粱遗传多样性和群体结构分析. 汪灿,周棱波,高旭,张国兵,程斌,曹宁,丁延庆,徐燕,邵明波,张立异. 2019

[5]甘蓝型油菜2009-2010年候选品种遗传多样性及群体结构. 许鲲,谷铁城,刘凤兰,李浩,陈碧云,高桂珍,伍晓明. 2012

[6]不同来源中国李(Prunus salicina L.)的多样性与近缘种关系. 魏潇,章秋平,刘宁,张玉萍,徐铭,刘硕,张玉君,马小雪,刘威生. 2019

[7]基于表型性状和SSR标记的山西省青狗尾草资源遗传多样性分析. 张耀元,任彦鑫,禾璐,张雁明,张彬,王兴春,李红英,韩渊怀. 2016

[8]基于SSR标记的花椰菜和青花菜遗传多样性分析. 盛小光,赵振卿,王建升,虞慧芳,沈钰森,王宣怀,顾宏辉. 2019

[9]西瓜核心种质遗传多样性分析及指纹图谱构建. 徐彦刚,姚协丰,李良俊,徐锦华,任润生,张曼,刘广,娄丽娜,朱凌丽,侯茜,徐建,羊杏平. 2021

[10]基于SSR标记的甜菜种质资源遗传多样性及群体结构分析. 赵尚敏,李晓东,付增娟,鄂圆圆,张辉,王良,张自强,郑文哲,张必周,白晨,张惠忠. 2021

[11]山西玉米丝黑穗病菌SSR遗传多样性与群体结构分析. 李新凤,尉天春,王雪梅,姜晓东,杨俊伟,冯铸,王建明. 2021

[12]基于KASP标记的贵州禾群体遗传多样性与结构分析. 吴娴,徐海峰,张志斌,王倩,宫彦龙,张习春,龙思芳,罗秦欢,宋莉,王忠妮,朱速松. 2021

[13]云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析. 陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有,王玲仙,王波,钟巧芳,付坚,程在全. 2019

[14]茄子种质遗传多样性及群体结构的SRAP分析. 谢立峰,李宁,李烨,姚明华. 2019

[15]利用SNP标记分析淳安花猪群体遗传多样性和群体结构. 戴丽荷,褚晓红,陈晓宇,杨娜娜,黄孙平,徐如海. 2021

[16]基于SNP芯片揭示中国玉米育种种质的遗传多样性与群体遗传结构. 赵久然,李春辉,宋伟,王元东,张如养,王继东,王凤格,田红丽,王蕊. 2018

[17]基于基因组信息的大蒲莲猪遗传多样性和群体结构变化分析. 张鑫,张婷,王怀中,杨晴,高世超,王彦平,王继英. 2024

[18]64份白辣椒种质资源的遗传多样性分析. 方萍萍,张婷,韦静,王雪艳,李朝森,刘慧琴,万红建,郭勤卫. 2024

[19]中国南方154份梨地方品种基于SSR标记的遗传多样性与群体结构分析. 齐丹,曹玉芬,胡红菊,张小双,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,徐家玉,刘超,詹俊宇,张思梦. 2023

[20]基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究. 刘振,成杨,杨培迪,赵洋,宁静,杨阳. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序