鹅圆环病毒JX1株ORF3基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 万春和

作者： 万春和;黄瑜

作者机构：

关键词： 鹅圆环病毒;ORF3基因;序列分析

期刊名称： 福建畜牧兽医

ISSN： 1003-4331

年卷期： 2020 年 42 卷 006 期

页码： 1-5

摘要： 为明确鹅圆环病毒(Goose circovirus,GoCV)ORF3基因特征,本研究通过对朗德鹅源GoCV代表株(JX1株)基因组分析发现,JX1株ORF3基因全长为300 bp,编码99个氨基酸,未发现典型的核定位信号.所编码ORF3蛋白理论等电点为8.84、不稳定指数为80.95,为不稳定蛋白;脂肪系数为89.70;总平均疏水性指数为-0.472.ORF3基因核苷酸同源性分析比较发现,JX1株与yk1株(AY633653)、yk3株(DQ192280)核苷酸同源性最高,均为100%;与DG1株(KT808650)的核苷酸同源性最低,仅为89.0%.ORF3基因遗传进化分析发现,ORF3基因的进化频率并不完全与GoCV全基因组一致,ORF3基因在遗传进化上表现出明显的地域性,但不表现出时间性.本研究首次对GoCV ORF3基因特征进行分析探讨,为后续开展GoCV ORF3基因生物学功能研究奠定基础.

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