三裂叶薯KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴胜男

作者： 吴胜男;孙凯;张海;刘峰;王凤

作者机构：

关键词： 三裂叶薯;KUP/HAK/KT基因家族;系统进化;逆境胁迫

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 017 期

页码： 52-58

收录情况： 北大核心

摘要： KUP/HAK/KT是植物中最大的钾转运体家族，在K+的吸收和运输及生物和非生物胁迫反应中起着关键作用。为了研究三裂叶薯ItbHAK基因家族的功能特征，利用生物信息学方法对三裂叶薯ItbHAK基因家族成员进行全面的生物信息学分析，包括系统进化、基因结构、染色定位、启动子分析、组织特异性和逆境胁迫下的表达模式分析。结果显示，在三裂叶薯中共鉴定出20个ItbHAK基因，系统进化关系将其分为4个进化簇。染色体定位结果显示，20个ItbHAK基因不均匀地分布在12条染色体上。三裂叶薯基因家族的蛋白质氨基酸数量在348～1 862之间，该家族的蛋白质均被定位到质膜上。基因结构分析结果显示，部分ItbHAK基因存在外显子丢失的情况。启动子分析发现，20个ItbHAK基因均含有参与生长发育、激素和生物/非生物胁迫的响应原件。三裂叶薯ItbHAK复制分析共发现5对大片段复制事件（ItbHAK1/ItbHAK9、ItbHAK3/ItbHAK8、ItbHAK3/ItbHAK19、ItbHAK4/ItbHAK6和ItbHAK8/ItbHAK19）和1对串联复制事件（ItbHAK16/ItbHAK17）。表达模式分析发现，ItbHAK基因在不同组织和逆境胁迫下的表达模式存在差异。研究结果为阐明三裂叶薯ItbHAK基因家族的进化关系及进一步研究三裂叶薯ItbHAK基因的功能特性提供了有价值的信息。

分类号： S531

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