思南黄牛的群体遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王胤晨

作者： 王胤晨;袁扬;张定红;赵恬;陈燕;张锦华

作者机构：

关键词： 思南黄牛;基因分型测序;单核苷酸多态性;群体进化;受选择基因

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2021 年 016 期

页码： 38-42,149-150

收录情况： 北大核心

摘要： 为了增加对思南黄牛群体遗传多样性和种群结构的了解,试验采集12～18月龄的42头思南黄牛、5头西门塔尔牛及7头思南黄牛与西门塔尔牛杂交牛的外周血液样品,采用基因分型测序（GBS）技术对思南黄牛群体单核苷酸多态性（SNP）特征进行分析,根据SNP特征进行种群结构分析、群体进化分析、主成分分析（PCA）和群体选择分析。结果表明:获得思南黄牛群体高质量SNP位点441 548个,平均SNP密度为12.338个/Mb。种群结构分析将54个样本分为A、B、C 3个集群,集群C和B亲缘关系较近;基于SNP的PCA分类结果和群体结构分析结果完全一致;群体选择分析发现3-磷酸-5-磷酸硫酸酯合成酶2 （3′-phosphoadenosine 5′-phosphosulfate synthase, PAPSS2）、表皮生长因子样重复序列和盘状蛋白Ⅰ类结构域3（EGF like repeats and discoid in domains 3,EDIL3）、ADP核糖基化因子类GTPase 13B（ADP ribosylation factor like GTPase 13B,ARL13B）、突触融合蛋白19（syntaxin 19,STX19）、酪氨酸激酶2受体酪氨酸激酶4（erb-b2 receptor tyrosine kinase 4,ERBB4）、JARID2（jumonji and AT-rich interaction domain containing 2）和基质相互作用分子2（stromal interaction molecule 2,STIM2）基因受到选择,其中PAPSS2、ARL13B、STX19、EDIL3基因与牛骨骼生长有关,ERBB4、JARID2、STIM2基因与肌肉发育有关,ERBB4基因与毛色选择有关。说明不同集群牛体型相异,可能与其受选择基因偏好相关。

分类号： S823.81

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