番茄Hsp70基因鉴定及系统发育关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王荣青

作者： 王荣青;万红建;李志邈;叶青静;阮美颖;周国治;姚祝平;杨悦俭

作者机构：

关键词： 番茄;Hsp70;生物信息学;系统发育关系

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2014 年 28 卷 03 期

页码： 378-385

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是植物应对高温和其他胁迫环境时所产生的一类特定的应激蛋白。本文以番茄基因组数据为基础,利用生物信息学方法对Hsp70基因家族进行鉴定与分析。结果表明,番茄至少含有22个Hsp70基因成员,蛋白质序列长度为210-890个氨基酸之间,具有0~12个内含子;具有4对重复基因;滑动窗口分析结果表明,这些基因中的一些区段(或者位点)可能受到正选择的压力。此外,序列比对发现这些Hsp70基因家族成员具有多个保守基序;染色体定位发现他们不均匀分布在番茄的11条染色体上;系统发育关系揭示番茄和拟南芥Hsp70基因家族成员可以分为4组,每组成员数目是变异的,并且存在3对旁系同源基因和7对直系同源基因,表明Hsp70基因家族在番茄和拟南芥分化之前就已经存在。

分类号： S641.2

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