香蕉MaTPS4基因序列及表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 许桂莺

作者： 许桂莺;徐碧玉;邢文婷;孙威;王安邦;宋顺;陈青;李科明

作者机构：

关键词： 香蕉;海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS4);生物信息学;表达分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2016 年 37 卷 03 期

页码： 532-538

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过随机克隆测序法从香蕉根系c DNA文库中获得海藻糖合成酶基因,命名为MaTPS4,全长c DNA序列为2 930 bp,含一个完整的开放阅读框2 574 bp,编码857个氨基酸。生物学信息分析表明,MaTPS4蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,pI5.59,结构域TPS和TPP。序列预测分析表明,MaTPS4蛋白定位于细胞质中,具有3个跨膜区域,不存在信号肽。与其他已知植物TPS氨基酸序列同源比对,同源性达到84.90%;进化关系分析表明,香蕉MaTPS4氨基酸与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)聚为一类,二者亲缘关系较近,同源性为99%。器官特异性分析表明,MaTPS4在香蕉根系、球茎、假茎、叶、花、果实各器官中均有表达,其中球茎、假茎、叶片和花中表达量较大,根及果实中表达量极少。q RT-PCR分析表明,MaTPS4在根系中的表达经干旱、盐胁迫后均增强,其中盐胁迫24 h时MaTPS4表达量较0 h时高5倍;冷胁迫下,MaTPS4表达量增加,并随时间延长下降,在6 h达到最大;ABA胁迫下,MaTPS4表达量增加,为0 h的5倍;在ACC和Foc TR4胁迫下,MaTPS4表达无变化。因此,MaTPS4可能通过依赖ABA途径调控抗逆胁迫相关基因表达,提高植株对非生物胁迫的抗逆性。

分类号： S668.1

  • 相关文献

[1]香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析. 王安邦,吴琼,舒海燕,许桂莺,苗红霞,柯建浩,贾彩虹,邢文婷,许奕. 2016

[2]香蕉海藻糖合成酶基因(MaTPS5)生物学及表达特性分析. 邢文婷,李科明,贾彩红,舒海燕,王安邦,孙佩光,许桂莺. 2017

[3]香蕉MaTET基因的克隆与表达分析. 姜成东,刘菊华,徐碧玉,贾彩虹,苗红霞,金志强. 2015

[4]香蕉MaTPS3基因序列及表达特性分析. 许桂莺,李科明,舒海燕,王安邦,常胜和,孙威,宋顺,许奕,金志强. 2015

[5]香蕉MaTPS1基因序列及其表达特性分析. 许桂莺,徐碧玉,邢文婷,贾彩虹,王卓,常胜和,王安邦,舒海燕,金志强. 2015

[6]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015

[7]香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析. 谭琳,康由发,郑晓燕,黄丽娜,陈娇,马蔚红. 2015

[8]香蕉MaERF-1基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 金志强,徐碧玉,黄东梅,胡伟,李凯,许奕. 2017

[9]香蕉水通道蛋白SIP2-1基因的克隆和表达分析. 许奕,侯晓婉,徐碧玉,金志强,胡伟,宋顺. 2016

[10]香蕉MaSIP2-2基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 许奕,金志强,徐碧玉,胡伟,黄东梅,宋顺. 2017

[11]香蕉MaFLS1基因克隆、生物信息学分析及功能解析. 肖伟军,胡玉林,汪乔英,段雅婕,胡会刚. 2024

[12]香蕉多酚氧化酶基因编码序列的电子克隆和生物信息学分析. 谭琳,陈娇,李奕星,李芬芳,郑晓燕,郑丽丽,臧小平,袁德保. 2013

[13]香蕉磷脂酶C基因生物信息学及表达分析. 殷菲胧,廖玲燕,刘云芬,孙健,郑培君,李丽,帅良. 2024

[14]香蕉SUS家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 吴建阳,陈妹,罗剑斌,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[15]香蕉NINV基因家族鉴定及分析. 吴建阳,陈妹,唐路平,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[16]香蕉酸性转化酶基因家族鉴定及分析. 吴建阳,陈妹,罗剑斌,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2025

[17]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017

[18]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021

[19]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[20]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序