中国美利奴羊毛密度相关基因的筛选

文献类型: 中文期刊

第一作者: 马海叶

作者: 马海叶;李忠慧;王嘉俊;唐丽苹;狄江;李文蓉

作者机构:

关键词: 中国美利奴羊;羊毛密度;RNA-seq;候选基因

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2025 年 62 卷 006 期

页码: 1530-1542

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]分析中国美利奴羊毛密度表型差异,筛选影响中国美利奴羊毛密度性状相关的候选基因,为阐明中国美利奴羊毛密度的分子调控机制提供参考.[方法]采用毛丛法对中国美利奴羊的羊毛密度和毛囊密度进行测定、统计分析,选择不同羊毛密度中国美利奴羊皮肤进行转录组测序,鉴定与羊毛密度性状相关的候选基因.[结果]中国美利奴高羊毛密度组(HWD组)的平均羊毛密度(9 852.02±1 673.98)根/cm2,极显著高于低羊毛密度组(LWD组)(5 390.61±1 365.67)根/cm2(P<0.01).HWD组与LWD组平均初级毛囊密度差异不显著,HWD组的平均次级毛囊密度、初级毛囊密度与次级毛囊密度比值、平均总毛囊密度均极显著高于LWD组(P<0.01).利用羊毛密度显著差异的中国美利奴羊皮肤转录组数据,HWD组相对于LWD组,共筛选出521 个差异表达基因,其中280 个基因表达上调、241 个基因表达下调.通过高、低密度组间差异基因富集、差异基因互作和差异基因表达验证等分析,筛选出KRT18、KRT16、LOC101116157、CCN3、SPARC、C7、ATP12A、ANGPT4、WNT16、S100A1 及S100A4 等,影响了中国美利奴羊毛生长及密度的差异表达基因.[结论]不同羊毛密度的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差异,这些基因表达可通过改变皮肤毛囊及羊毛生长等过程影响羊毛密度.

分类号: S826.8

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