新疆雪莲全长cDNA文库构建及表达序列标签(ESTs)特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王博

作者： 王博;艾秀莲;王志方;李芳;罗明

作者机构：

关键词： 新疆雪莲;cDNA文库;λTripLEx2;表达序列标签

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2008 年 45 卷 01 期

页码： 56-60

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以野生新疆雪莲(Saussurea involucrata Kar.et Kit)为研究材料,利用Creator SMARTTMcDNA Library Construction技术构建了雪莲全长cDNA文库,从野生雪莲中提取总RNA和mRNA,用分离到的微量mRNA合成cDNA第1链。通过长距离PCR扩增得到足够量的双链cDNA。将SfiⅠ酶切后并纯化的cDNA片段连接到经SfiⅠ酶切的噬菌体λTripIEX2上,并对噬菌体进行包装,建成cDNA的全长库。经大肠杆菌XL1-Blue平板检测,原始文库滴度达4.03×107(pfu/mL)。随机挑选500个克隆进行序列测定,PCR鉴定结果显示多数插入片段均在500 bp以上。将所测序列经GenBank检索和生物信息学比较,共有56个序列为非冗余数据。其中有14个cDNA片段序列在GenBank上无明显的同源性,42个片段与已报道的基因有较高的同源性。这些EST数据为进一步筛选和克隆雪莲特异性表达基因提供了材料平台,为雪莲基因组数据增补了大量信息。

分类号： S567.239

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