许氏平鲉对慢性高温胁迫响应的转录组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谭杰

作者： 谭杰;张正;刘长琳;王亮;肖文杰;姜达

作者机构：

关键词： 许氏平鲉;高温胁迫;转录组;鳃;肝脏;肠道

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2024 年 31 卷 012 期

页码： 1453-1463

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探索许氏平鲉（Sebastes schlegelii）高温胁迫条件下基因表达水平的变化,利用Illumina Hiseq 4000测序平台分别对许氏平鲉高温处理组（温度由18℃缓慢升至27℃后养殖5d）和常温对照组（18℃下养殖）的鳃、肝和肠道组织进行了转录组测序。以|log2fold change|≥1和FDR（false discovery rate,错误发现率）<0.05作为显著差异表达基因（DEGs）筛选条件。在鳃组织中,共筛选出306个DEGs,其中96个基因显著上调,210个基因显著下调;在肝脏组织中,共筛选出806个DEGs,其中382个基因显著上调, 424个基因显著下调;在肠道组织中,共筛选出343个DEGs,其中162个基因显著上调, 181个基因显著下调。3个组织共表达的DEGs有12个。GO功能注释分析结果显示,鳃组织中的DEGs较多富集在蛋白水解作用、胞外区、结构分子活性、受体调节器活性、受体配体活性等功能中;肝组织中DEGs较多富集在脂肪代谢过程、细胞氨基酸代谢过程、细胞质、氧化还原酶活性等功能中;肠道组织中DEGs较多富集在氧化还原过程、胞外区、辅因子结合等功能中。运用逆转录实时荧光定量PCR （RT-qPCR）对10个DEGs的表达量进行验证,结果显示, RT-qPCR结果与转录组分析结果一致,表明转录组分析可靠。本研究为解析许氏平鲉对慢性高温胁迫应激反应的分子机制提供了转录水平上的参考数据。

分类号： S917.4

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