出芽短梗霉菌株PA-2侵染藜叶片的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晓芳

作者： 刘晓芳;杨莹;高汉峰;程亮;朱海霞;郭青云

作者机构：

关键词： 出芽短梗霉菌株PA-2;藜;转录组分析;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1521-1534

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 藜（Chenopodium album）是一种极具竞争力的一年生世界性杂草。为了探究出芽短梗霉（Aureobasidium pullulans）菌株PA-2侵染藜的分子机制，利用RAN-seq技术分析PA-2侵染藜叶片0 （CK）、1 （T1）、3 （T3）、5（T5）、7 （T7） d的转录组差异。基于转录组数据组装，共得到69 404条Unigene，其中50.13%的序列在KEGG、NR、COG以及SwissProt四大数据库中得到注释。利用GO数据库对差异表达基因进行分析，结果发现差异表达基因主要富集在质体、类囊体、叶绿体、细胞膜以及氧化还原酶活性等方面。利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现，PA-2侵染主要影响了植物MAPK信号通路、植物病原体相互作用、苯丙烷生物合成和植物激素信号转导等途径中关键基因的表达水平。经PA-2处理后，通过转录组测序筛选出与叶绿体相关的差异基因主要集中在光系统Ⅱ（PSⅡ），分别是psbY、psbB以及psbO基因，其次是与碳固定过程紧密相关的3-磷酸甘油醛脱氢酶（GAPB）和果糖二磷酸醛缩酶（FBA3）的基因，影响叶绿体膜流动性的乙酰辅酶A羧化酶（BCCP1）以及影响可溶性糖含量的葡聚糖水二激酶（GWD1）。研究结果初步明确了菌株PA-2防除藜的分子机制，为PA-2生物除草制剂商品化以及杂草的生物防治奠定一定的理论基础。

分类号： S451

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