擎天凤梨花器官全长cDNA文库的构建及EST分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘建新

作者： 刘建新;沈福泉;田丹青;张智;葛亚英;沈晓岚;俞信英;王炜勇

作者机构：

关键词： 擎天凤梨;cDNA文库;SMART;EST;COG

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2009 年 7 卷 06 期

页码： 1137-1143

收录情况： CSCD

摘要： 为了通过基因工程手段来培育花色丰富、花型奇特的擎天凤梨新品种,从擎天凤梨中筛选出花色、花型相关调控基因则是十分必要的。本研究以擎天凤梨属品种Ostara为材料,采用SMART技术成功构建了擎天凤梨花器官的质粒型全长cDNA文库,初始文库滴度为3×106,插入片段平均长度大于1kb;随机挑取2004个阳性克隆进行5'EST测序,获得高质量序列1758条,经拼接获得1365条单基因簇(unigene),其中跨叠群(contig)175个和单条序列(singlet)1195个;经ORF寻找共获得有效ORF1283条;经COG分析EST序列编码的蛋白质被分为22类;经Blast分析后,获得一批花色、花器官发育、花期调控以及其它育种价值基因(包括cDNA全长或片段)。该研究结果为擎天凤梨的花色、花型转基因等育种奠定了基础。

分类号： S682.39

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