兔出血症病毒(RHDV)全基因组克隆与分子流行病学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 向华

作者： 向华;宣华;隋慧;王贵平;王文成;李尚波;卫广森

作者机构：

关键词： 兔出血症病毒;基因组;序列分析

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2006 年 28 卷 05 期

页码： 592-595

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank已发表的多株RHDV全基因组序列,设计3对扩增RHDVCD株的特异性引物,扩增了RHDVCD株包含全序列的3个片段,并分别克隆到pMD18-T载体上。根据引物上唯一的交叉酶切位点,把三个克隆片段同时克隆到pUC18载体上,获得了RHDVCD株全基因组克隆,测定了全基因组序列(GenBankaccessionnumberAY523410)。进行了CD株全序列与GenBank上已发布的其他6株全序列比较及基因进化树分析。发现除CD株外,其余6株(西班牙AST-89株、法国SD株、意大利BS89株、德国分离1株、德国分离2株、澳大利亚CzechV351株)之间的同源性均很高,在93.9%～100%之间,而CD株与其他6株之间的同源性均较低,在89.0%～89.6%之间。德国的2个分离株序列完全相同,应为同一毒株。进化树分析表明,此7株病毒可形成2个明显的分支,中国CD株形成一个分支,其余欧洲、澳大利亚分离株开成一个分支,具有明显地域差异特征。

分类号： S858.291

  • 相关文献

[1]兔出血症病毒衣壳蛋白VP60基因克隆与序列分析. 刘怀然,陈洪岩,关云涛,王云峰,李昌文,夏长友,张立成. 2002

[2]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[3]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[4]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014

[5]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010

[6]猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析. 李海花,李秀丽,张莉,孙英峰,任卫科,路超,田向学. 2014

[7]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[8]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[9]猪圆环病毒2型山东株全基因组的克隆与序列分析. 柳美玲,秦晓冰,王爱华,牛晋国,单虎. 2008

[10]三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析. 马友记,柳纪省,李志勇,殷相平,杨彬,李发弟,张利. 2007

[11]猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析. 王贵平,蒋智勇,宋长绪,高向阳,赵亚华,林志雄,朱道中. 2004

[12]高等植物线粒体基因组测序和序列分析. 李双双,薛龙飞,苏爱国,雷彬彬,王玉美,华金平. 2011

[13]减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析. 董春娜,李刚,邱文英,张坤,哈小琴. 2010

[14]蓖麻基因组Mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析. 覃碧,王萌,刘巧玲,张宇. 2014

[15]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013

[16]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[17]一株Asia1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析. 李爽,李勐,高明春,于力,周国辉,王君伟. 2008

[18]黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析. 严丹侃,张海珊,郑红英,燕飞,章东方. 2016

[19]口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析. 张显升,刘在新,赵启组,常惠芸,谢庆阁. 2003

[20]蚕豆萎蔫病毒2号安徽分离物全基因组序列测定与分析. 严丹侃,郑红英,张海珊,沈艳,顾江涛,章东方,燕飞. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序