葡萄CHX基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜宜洋

作者： 杜宜洋;连红娟;李晓梅;谭敏;杨镕兆;刘政海;杨兆亮;唐晓萍;董志刚;李捷

作者机构：

关键词： 葡萄;CHX基因家族;全基因组鉴定;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 024 期

页码： 8009-8021

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CHX(Cation/H+exchanger)基因家族是CPA(Cation proton antiporter)基因家族的一个亚家族,家族基因广泛参与维持植物体内Na+/K+离子平衡的调控过程,对植物维持细胞离子浓度、花器官的发育起着至关重要的作用.本研究以葡萄为材料,共鉴定出19个VvCX基因,命名为VvCHX1~VvCHX19.运用生物信息学的方法,系统地分析了葡萄VvCHXs基因的结构、蛋白理化性质、保守基序、系统进化,同源基因分析和组织特异性表达.结果表明,根据多物种CHX蛋白的进化树分析将19个VvCHX家族成员划分为4类;VvCHX家族基因不均匀的分布于7条染色体上,其中3对基因存在串联重复现象;同源基因分析表明,葡萄VvCHX家族成员可能在维持离子浓度、花器官发育中起到重要作用;组织特异性表达分析表明,绝大多数葡萄VvCHX基因家族成员在雄蕊、花粉、花中表达量较高.本研究进一步探究CHX基因家族调控植物抗逆的分子机制提供依据.

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